RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TCP11X1B4DZS4 312 aa30.88■■■□□ 2.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP1B1P05026 303 aa30.88■■■□□ 2.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 ALPPP05187 535 aa30.88■■■□□ 2.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLCN2P51788 898 aa30.88■■■□□ 2.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 PGDP52209 483 aa30.88■■■□□ 2.53
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CTDNEP1-209ENST00000574205 REEP4Q9H6H4 257 aa30.88■■■□□ 2.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNK13Q9HB14 408 aa30.88■■■□□ 2.53
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CTDNEP1-209ENST00000574205 GOLGA8NF8WBI6 632 aa30.87■■■□□ 2.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TGDSO95455 350 aa30.87■■■□□ 2.53
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CTDNEP1-209ENST00000574205 OR8D2Q9GZM6 311 aa30.87■■■□□ 2.53
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa30.86■■■□□ 2.53
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CTDNEP1-209ENST00000574205 H3F3CQ6NXT2 135 aa30.86■■■□□ 2.53
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SIRT6Q8N6T7 355 aa30.86■■■□□ 2.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 FBXL20Q96IG2 436 aa30.86■■■□□ 2.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 CXorf21Q9HAI6 301 aa30.86■■■□□ 2.53
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CTDNEP1-209ENST00000574205 AKAP10O43572 662 aa30.85■■■□□ 2.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 TBX19O60806 448 aa30.85■■■□□ 2.53
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP30.85■■■□□ 2.53
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CTDNEP1-209ENST00000574205 NT5EP21589 574 aa30.84■■■□□ 2.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 HPCAL1P37235 193 aa30.84■■■□□ 2.53
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC134Q9H6E4 229 aa30.84■■■□□ 2.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 TEKT2Q9UIF3 430 aa30.84■■■□□ 2.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP30.84■■■□□ 2.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa30.84■■■□□ 2.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM208BQ5VWN6 2430 aa30.84■■■□□ 2.53
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MPIP34949 423 aa30.83■■■□□ 2.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 MDH1P40925 334 aaKnown RBP30.83■■■□□ 2.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 ISLR2Q6UXK2 745 aa30.83■■■□□ 2.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPATA19Q7Z5L4 167 aa30.83■■■□□ 2.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC116Q8IYX3 515 aa30.83■■■□□ 2.53
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC5A8Q8N695 610 aa30.83■■■□□ 2.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 CEP70Q8NHQ1 597 aa30.83■■■□□ 2.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 BBS4Q96RK4 519 aa30.83■■■□□ 2.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 CNPPD1Q9BV87 410 aa30.83■■■□□ 2.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC25A18Q9H1K4 315 aa30.83■■■□□ 2.53
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP30.83■■■□□ 2.53
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa30.83■■■□□ 2.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 NXNQ6DKJ4 435 aa30.83■■■□□ 2.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 DEFB126Q9BYW3 111 aa30.83■■■□□ 2.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 SH3BP4Q9P0V3 963 aa30.83■■■□□ 2.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 ERVK-19Q9WJR5 959 aa30.83■■■□□ 2.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHD6Q8TD26 2715 aa30.83■■■□□ 2.53
CTDNEP1-209ENST00000574205 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa30.82■■■□□ 2.52
CTDNEP1-209ENST00000574205 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa30.82■■■□□ 2.52
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