RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558534.5

RABGGTA-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 753 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-205ENST00000558534 APIPQ96GX9 242 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 PPP3R2Q96LZ3 170 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 CNPPD1Q9BV87 410 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 ACBD3Q9H3P7 528 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 LRTM1Q9HBL6 345 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 TMBIM4Q9HC24 238 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 MIEF1Q9NQG6 463 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 LRFN1Q9P244 771 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 UTS2RQ9UKP6 389 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 FIS1Q9Y3D6 152 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 FASNP49327 2511 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 CAPN14A8MX76 684 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 ITGA10O75578 1167 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 RASAL1O95294 804 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 DDAH2O95865 285 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 ATP1B1P05026 303 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 CREB1P16220 341 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 PCSK2P16519 638 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 MPIP34949 423 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 RPL3P39023 403 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 ASMTP46597 345 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 MLLT10P55197 1068 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 RNF4P78317 190 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 PSPHP78330 225 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 OR1C1Q15619 314 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 MPEG1Q2M385 716 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF766Q5HY98 468 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 ATG16L1Q676U5 607 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 OPN5Q6U736 354 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 KIF2BQ8N4N8 673 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 C16orf78Q8WTQ4 265 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 TWIST2Q8WVJ9 160 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 ASB15Q8WXK1 588 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 VIPAS39Q9H9C1 493 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 MYNNQ9NPC7 610 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 PLA2G3Q9NZ20 509 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 MYOTQ9UBF9 498 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 MAPRE3Q9UPY8 281 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 A8MVJ9 347 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 PGRMC2O15173 223 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 IGKV3-11P04433 115 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 IL3P08700 152 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 DHRS4L1P0CG22 281 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 DDCP20711 480 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 NT5EP21589 574 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 SERPINB3P29508 390 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 TMED10P49755 219 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 KCNC4Q03721 635 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 CHI3L2Q15782 390 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 FCRLBQ6BAA4 426 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 NOXRED1Q6NXP6 359 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM9CQ8IZT9 166 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 TAGAPQ8N103 731 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 POGLUT1Q8NBL1 392 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF721Q8TF20 911 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 CXorf21Q9HAI6 301 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 HPF1Q9NWY4 346 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 CES1P1Q9UKY3 287 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 ERVK-11Q9UQG0 969 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 MYO18BQ8IUG5 2567 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 TMEM120BA0PK00 339 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC25A12O75746 678 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 CHRNGP07510 517 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 CHN1P15882 459 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 NTSP30990 170 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 CD96P40200 585 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 NRG3P56975 720 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 ERVK-8P63133 956 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 RPP38P78345 283 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 RAE1P78406 368 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 C2orf80Q0P641 193 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 SMU1Q2TAY7 513 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC25A25Q6KCM7 469 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 SCIMPQ6UWF3 145 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 VWA5B2Q8N398 1253 aa14.67□□□□□ -0.06
RABGGTA-205ENST00000558534 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms