RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557428.1

PCNX1-215, Transcript of pecanex 1, humanhuman

TSL 4

Gene PCNX1, Length 541 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1-215ENST00000557428 KRT14P02533 472 aa7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 SERPINB3P29508 390 aa7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 GCKP35557 465 aa7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 KCNJ5P48544 419 aa7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 CDK9P50750 372 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 SARNPP82979 210 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 KRTAP1-1Q07627 177 aa7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 GPS1Q13098 491 aa7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 SERTAD2Q14140 314 aa7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 PPP1R7Q15435 360 aa7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 MPEG1Q2M385 716 aa7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 BBS9Q3SYG4 887 aa7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 CHRFAM7AQ494W8 412 aa7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 VASNQ6EMK4 673 aa7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 TTC27Q6P3X3 843 aa7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 TMEM64Q6YI46 380 aa7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 SLC29A4Q7RTT9 530 aa7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 P4HA3Q7Z4N8 544 aa7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 OR4N5Q8IXE1 308 aa7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 KLHL7Q8IXQ5 586 aa7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 MEIOBQ8N635 442 aa7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 ZNF721Q8TF20 911 aa7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 FBXL8Q96CD0 374 aa7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 MS4A6EQ96DS6 147 aa7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 WDYHV1Q96HA8 205 aa7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 RILPQ96NA2 401 aa7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 GNRHR2Q96P88 292 aa7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 SERINC2Q96SA4 455 aa7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 EGFL8Q99944 293 aa7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 TUBA1CQ9BQE3 449 aa7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 GSX2Q9BZM3 304 aa7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 CXorf56Q9H5V9 222 aa7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 CALHM2Q9HA72 323 aa7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 PROK2Q9HC23 129 aa7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 SH2D2AQ9NP31 389 aa7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 TAS2R13Q9NYV9 303 aa7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 VTI1BQ9UEU0 232 aa7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 FBXO5Q9UKT4 447 aa7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 SLC22A14Q9Y267 594 aa7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 SPACA6W5XKT8 324 aa7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 EXPH5Q8NEV8 1989 aa7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 MED12Q93074 2177 aa7.36□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 UQCRHLA0A096LP55 91 aa7.35□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 ANKDD1BA6NHY2 528 aa7.35□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 GOLGA8MH3BSY2 632 aa7.35□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 HRKO00198 91 aa7.35□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 CYR61O00622 381 aa7.35□□□□□ -1.23
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PCNX1-215ENST00000557428 WDR47O94967 919 aa7.35□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 C1QAP02745 245 aa7.35□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 FBXO45P0C2W1 286 aa7.35□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 TPSB2P20231 275 aa7.35□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 SOX18P35713 384 aa7.35□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 SLCO1A2P46721 670 aa7.35□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 MMP16P51512 607 aa7.35□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 PGGT1BP53609 377 aa7.35□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 MTTPP55157 894 aa7.35□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 CDKN2DP55273 166 aa7.35□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 AP1S2P56377 157 aa7.35□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 FBXW4P57775 412 aa7.35□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 HERVK_113P63132 956 aa7.35□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 ERVK-8P63133 956 aa7.35□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 FAM27E3Q08E93 113 aa7.35□□□□□ -1.23
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PCNX1-215ENST00000557428 CLEC12BQ2HXU8 276 aa7.35□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa7.35□□□□□ -1.23
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PCNX1-215ENST00000557428 TTLQ8NG68 377 aa7.35□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 OR2L5Q8NG80 312 aa7.35□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 NUBPLQ8TB37 319 aa7.35□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 RDH11Q8TC12 318 aa7.35□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 CALML6Q8TD86 181 aa7.35□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 ART5Q96L15 291 aa7.35□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 QRFPRQ96P65 431 aa7.35□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 TM9SF2Q99805 663 aa7.35□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa7.35□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 FAM167BQ9BTA0 163 aa7.35□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 ERVK-6Q9BXR3 956 aa7.35□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa7.35□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 PIGMQ9H3S5 423 aa7.35□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 ADGRE2Q9UHX3 823 aa7.35□□□□□ -1.23
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