RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557030.5

ATXN3-246, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 807 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-246ENST00000557030 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 BEX3Q00994 111 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 RHAGQ02094 409 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 EMX2Q04743 252 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 UBE3AQ05086 875 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 LIPEQ05469 1076 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 CHRNB3Q05901 458 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 LCP2Q13094 533 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 RCAN2Q14206 197 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 POU6F1Q14863 301 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 PTGR1Q14914 329 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 OXA1LQ15070 435 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 PPP1R3AQ16821 1122 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 DGUOKQ16854 277 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 UGT3A2Q3SY77 523 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 ANKDD1AQ495B1 522 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 VPS26BQ4G0F5 336 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 GXYLT1Q4G148 440 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 UNC50Q53HI1 259 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 FGD3Q5JSP0 725 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 RAB41Q5JT25 222 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 FAM72AQ5TYM5 149 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 SYPL2Q5VXT5 272 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 FAM72DQ6L9T8 149 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 NANOGP8Q6NSW7 305 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 MTFR2Q6P444 385 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 CFAP161Q6P656 301 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 C16orf54Q6UWD8 224 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 CLEC20AQ6ZU45 233 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 TLK2Q86UE8 772 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 IGFN1Q86VF2 1251 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 FAM72BQ86X60 149 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 MFSD6LQ8IWD5 586 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 OFCC1Q8IZS5 231 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 DPP10Q8N608 796 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 NPWQ8N729 165 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 SETD9Q8NE22 299 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 ZNF555Q8NEP9 628 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 TRPV1Q8NER1 839 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 RHEBL1Q8TAI7 183 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 PEX13Q92968 403 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 SLC35B4Q969S0 331 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 VPS33AQ96AX1 596 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 PHF21BQ96EK2 531 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 VMP1Q96GC9 406 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 PGLYRP2Q96PD5 576 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 FEM1AQ9BSK4 669 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 CENPOQ9BU64 300 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 OSBPL10Q9BXB5 764 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 UGT2B28Q9BY64 529 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 ULBP1Q9BZM6 244 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 TKTL2Q9H0I9 626 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 SLC25A51Q9H1U9 297 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 ALG9Q9H6U8 611 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 NANOGQ9H9S0 305 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 INIPQ9NRY2 104 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 AIG1Q9NVV5 245 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 TMEM160Q9NX00 188 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 COMMD8Q9NX08 183 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 USE1Q9NZ43 259 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 DNAJB9Q9UBS3 223 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 ENPP5Q9UJA9 477 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 GINS2Q9Y248 185 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 DTX4Q9Y2E6 619 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 TRIM17Q9Y577 477 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 ORC6Q9Y5N6 252 aa4.49□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 BRCA2P51587 3418 aa4.48□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa4.48□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 C17orf102A2RUQ5 167 aa4.48□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 ISPDA4D126 451 aa4.48□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 FAM149AA5PLN7 773 aa4.48□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 SAGE2PA6NJ88 616 aa4.48□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 YJEFN3A6XGL0 299 aa4.48□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 M0R3G1 203 aa4.48□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 DFFAO00273 331 aa4.48□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 SYN3O14994 580 aa4.48□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 PFDN6O15212 129 aa4.48□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 AQP9O43315 295 aa4.48□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 KERAO60938 352 aa4.48□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 SLC22A3O75751 556 aa4.48□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 BEST1O76090 585 aa4.48□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 CDK14O94921 469 aa4.48□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 SNAP29O95721 258 aa4.48□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 MLYCDO95822 493 aa4.48□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 ALPLP05186 524 aa4.48□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 UGT2B4P06133 528 aa4.48□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 FYNP06241 537 aa4.48□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 CNPP09543 421 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
ATXN3-246ENST00000557030 TFPTP0C1Z6 253 aa4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.4 ms