RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546891.5

CS-205, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 911 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-205ENST00000546891 A0A1W2PRQ8 180 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 CCRL2O00421 344 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 RTCAO00442 366 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 MAGEB3O15480 346 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 MED26O95402 600 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 AGR2O95994 175 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 GASTP01350 101 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 FHP07954 510 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 STSP08842 583 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 BMP4P12644 408 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 ACP5P13686 325 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 CNR2P34972 360 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 LIPAP38571 399 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 SLC15A1P46059 708 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 GSSP48637 474 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 RGS6P49758 472 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 XKP51811 444 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 CASP9P55211 416 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 LSM3P62310 102 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 PRKCDQ05655 676 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 MESP2Q0VG99 397 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 C1DQ13901 141 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 NCF4Q15080 339 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 OCLNQ16625 522 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 DUSP7Q16829 419 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 SLC25A30Q5SVS4 291 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 C12orf73Q69YU5 71 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 PLAG1Q6DJT9 500 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 SDE2Q6IQ49 451 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 TCTN3Q6NUS6 607 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 DEF8Q6ZN54 512 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 MMP21Q8N119 569 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 MFSD9Q8NBP5 474 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 B3GNT7Q8NFL0 401 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 OR2L5Q8NG80 312 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 GPR32P1Q8NGA4 272 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 OR2A1Q8NGT9 310 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 UBE2FQ969M7 185 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 ELSPBP1Q96BH3 223 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 TMEM80Q96HE8 168 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 PRRC1Q96M27 445 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 FAM210AQ96ND0 272 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 RHNO1Q9BSD3 238 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 FNDC11Q9BVV2 318 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 MND1Q9BWT6 205 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 TEX12Q9BXU0 123 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 OR51I1Q9H343 314 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 GLIPR2Q9H4G4 154 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 ANKRD19PQ9H560 264 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 SP140LQ9H930 580 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 C3orf14Q9HBI5 128 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 SLC25A19Q9HC21 320 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 FZD3Q9NPG1 666 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 LHX9Q9NQ69 397 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 PRDM9Q9NQV7 894 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 GPR83Q9NYM4 423 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 TRPC4Q9UBN4 977 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 SCML1Q9UN30 329 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 SNX7Q9UNH6 387 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 LIPT1Q9Y234 373 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 DOCK6Q96HP0 2047 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 FEZF1A0PJY2 475 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 GSAPA4D1B5 854 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 AGAP5A6NIR3 686 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 PRR19A6NJB7 356 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 PDZK1P1A8MUH7 402 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 MAN2B1O00754 1011 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 TOR1BO14657 336 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 ZW10O43264 779 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 EMC8O43402 210 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 NME6O75414 186 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 RECKO95980 971 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 PTHP01270 115 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 SERPIND1P05546 499 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 OR12D1P0DN82 309 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 ACADMP11310 421 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-205ENST00000546891 GADD45AP24522 165 aa9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms