RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538502.5

SORT1-209, Transcript of sortilin 1, humanhuman

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Gene SORT1, Length 6,993 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1-209ENST00000538502 LRRTM4Q86VH4 590 aa6.63□□□□□ -1.35
SORT1-209ENST00000538502 TPRA1Q86W33 373 aa6.63□□□□□ -1.35
SORT1-209ENST00000538502 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SORT1-209ENST00000538502 RASGRP3Q8IV61 690 aa6.63□□□□□ -1.35
SORT1-209ENST00000538502 PQLC3Q8N755 202 aa6.63□□□□□ -1.35
SORT1-209ENST00000538502 GTF2H4Q92759 462 aa6.63□□□□□ -1.35
SORT1-209ENST00000538502 SMARCD2Q92925 531 aa6.63□□□□□ -1.35
SORT1-209ENST00000538502 MUL1Q969V5 352 aa6.63□□□□□ -1.35
SORT1-209ENST00000538502 MROQ9BYG7 248 aa6.63□□□□□ -1.35
SORT1-209ENST00000538502 RPS10P5Q9NQ39 176 aa6.63□□□□□ -1.35
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SORT1-209ENST00000538502 E2F3O00716 465 aa6.63□□□□□ -1.35
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SORT1-209ENST00000538502 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
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SORT1-209ENST00000538502 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SORT1-209ENST00000538502 SLC6A9P48067 706 aa6.63□□□□□ -1.35
SORT1-209ENST00000538502 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
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SORT1-209ENST00000538502 VGLL4Q14135 290 aa6.63□□□□□ -1.35
SORT1-209ENST00000538502 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SORT1-209ENST00000538502 KCNJ8Q15842 424 aa6.63□□□□□ -1.35
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SORT1-209ENST00000538502 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa6.63□□□□□ -1.35
SORT1-209ENST00000538502 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
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SORT1-209ENST00000538502 RNF128Q8TEB7 428 aa6.63□□□□□ -1.35
SORT1-209ENST00000538502 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
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SORT1-209ENST00000538502 GAL3ST1Q99999 423 aa6.63□□□□□ -1.35
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SORT1-209ENST00000538502 WDR45Q9Y484 360 aa6.63□□□□□ -1.35
SORT1-209ENST00000538502 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SORT1-209ENST00000538502 TNFRSF10AO00220 468 aa6.63□□□□□ -1.35
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SORT1-209ENST00000538502 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
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SORT1-209ENST00000538502 CDK3Q00526 305 aa6.63□□□□□ -1.35
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SORT1-209ENST00000538502 ZNF416Q9BWM5 594 aa6.63□□□□□ -1.35
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SORT1-209ENST00000538502 BEX1Q9HBH7 125 aa6.63□□□□□ -1.35
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SORT1-209ENST00000538502 SLC7A11Q9UPY5 501 aa6.63□□□□□ -1.35
SORT1-209ENST00000538502 TCHHQ07283 1943 aa6.63□□□□□ -1.35
SORT1-209ENST00000538502 PRAMEF11O60813 436 aa6.63□□□□□ -1.35
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SORT1-209ENST00000538502 TP53P04637 393 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
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SORT1-209ENST00000538502 GAL3ST4Q96RP7 486 aa6.63□□□□□ -1.35
SORT1-209ENST00000538502 SLC6A7Q99884 636 aa6.63□□□□□ -1.35
SORT1-209ENST00000538502 ABRACLQ9P1F3 81 aa6.63□□□□□ -1.35
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SORT1-209ENST00000538502 NDUFS4O43181 175 aa6.63□□□□□ -1.35
SORT1-209ENST00000538502 TLL1O43897 1013 aa6.63□□□□□ -1.35
SORT1-209ENST00000538502 SEC14L2O76054 403 aa6.63□□□□□ -1.35
SORT1-209ENST00000538502 SLC22A5O76082 557 aa6.63□□□□□ -1.35
SORT1-209ENST00000538502 FHP07954 510 aa6.63□□□□□ -1.35
SORT1-209ENST00000538502 OR8U9P0C7N5 309 aa6.63□□□□□ -1.35
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