RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532032.5

ATXN3-215, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene ATXN3, Length 1,191 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-215	ENST00000532032	DGKA	P23743	735 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	SLC1A2	P43004	574 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	CD151	P48509	253 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	ENTPD1	P49961	510 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	SLC7A2	P52569	658 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	DAOA	P59103	153 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	TPI1	P60174	286 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	PHEX	P78562	749 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	SLC36A3	Q495N2	470 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	COQ5	Q5HYK3	327 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	RAB41	Q5JT25	222 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	MPP7	Q5T2T1	576 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	GPR141	Q7Z602	305 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	GALNT7	Q86SF2	657 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	LINC00523	Q86TU6	105 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	CUZD1	Q86UP6	607 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	DHFR2	Q86XF0	187 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	CPNE9	Q8IYJ1	553 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	CBR4	Q8N4T8	237 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	FAM47B	Q8NA70	645 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	SGF29	Q96ES7	293 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	VPS50	Q96JG6	964 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	APOLD1	Q96LR9	279 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	COG8	Q96MW5	612 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	FCRL5	Q96RD9	977 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	IL12RB2	Q99665	862 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	OLFM1	Q99784	485 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	CIB1	Q99828	191 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	TRIM15	Q9C019	465 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	RPF2	Q9H7B2	306 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	CMTM6	Q9NX76	183 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	SATB2	Q9UPW6	733 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	TSC2	P49815	1807 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	TENM4	Q6N022	2769 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	DHRS12	A0PJE2	317 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	DYTN	A2CJ06	578 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032		H3BUI4	141 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	SCAMP1	O15126	338 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	FFAR2	O15552	330 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	SLC7A4	O43246	635 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	ATP6V1G1	O75348	118 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	SERPINB7	O75635	380 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	TNFSF15	O95150	251 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	CPNE6	O95741	557 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	IGLV3-25	P01717	112 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	GPI	P06744	558 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	THEGL	P0DJG4	465 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	GIMD1	P0DJR0	217 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	IDO1	P14902	403 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	ZNF12	P17014	697 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	UGT1A6	P19224	532 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	CAPN3	P20807	821 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	IMPDH1	P20839	514 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	SAT1	P21673	171 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-215	ENST00000532032	CD70	P32970	193 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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