RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 TNFRSF11BO00300 401 aa10.18□□□□□ -0.78
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SH3BP2-209ENST00000504450 P2RX6O15547 441 aa10.18□□□□□ -0.78
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SH3BP2-209ENST00000504450 FESP07332 822 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 ITGA2P17301 1181 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 TNFRSF1BP20333 461 aa10.18□□□□□ -0.78
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SH3BP2-209ENST00000504450 RUNX2Q13950 521 aa10.18□□□□□ -0.78
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SH3BP2-209ENST00000504450 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP10.18□□□□□ -0.78
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SH3BP2-209ENST00000504450 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
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SH3BP2-209ENST00000504450 ZBED5Q49AG3 693 aa10.18□□□□□ -0.78
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SH3BP2-209ENST00000504450 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
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SH3BP2-209ENST00000504450 BBS4Q96RK4 519 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 PSD2Q9BQI7 771 aa10.18□□□□□ -0.78
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SH3BP2-209ENST00000504450 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A1W2PS29 197 aa10.17□□□□□ -0.78
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SH3BP2-209ENST00000504450 RHCEP18577 417 aa10.17□□□□□ -0.78
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SH3BP2-209ENST00000504450 OR1E2P47887 323 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 KCNJ5P48544 419 aa10.17□□□□□ -0.78
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SH3BP2-209ENST00000504450 LPAL2Q16609 132 aa10.17□□□□□ -0.78
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SH3BP2-209ENST00000504450 OR51I1Q9H343 314 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 RUBCNLQ9H714 662 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 EXD2Q9NVH0 621 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 PHF11Q9UIL8 331 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 KCND3Q9UK17 655 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa10.17□□□□□ -0.78
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SH3BP2-209ENST00000504450 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
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