RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	B3GALT2	O43825	422 aa		9.97	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	GUCA1C	O95843	209 aa		9.97	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	CCL3	P10147	92 aa		9.97	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	TPSB2	P20231	275 aa		9.97	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	PIGA	P37287	484 aa		9.97	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	TRPC1	P48995	793 aa		9.97	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	VPS41	P49754	854 aa		9.97	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	RCN2	Q14257	317 aa		9.97	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	TPSAB1	Q15661	275 aa		9.97	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	BBS9	Q3SYG4	887 aa		9.97	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511		Q5PR19	223 aa		9.97	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		9.97	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		9.97	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	NEIL2	Q969S2	332 aa		9.97	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		9.97	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	LINGO1	Q96FE5	620 aa		9.97	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	NDN	Q99608	321 aa		9.97	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		9.97	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		9.97	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		9.97	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		9.97	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	TAS2R13	Q9NYV9	303 aa		9.97	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		9.97	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		9.97	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	9.96	□□□□□ -0.81
SKAP2-209	ENST00000497511	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	SHISA3	A0PJX4	238 aa		9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	MAGEB16	A2A368	324 aa		9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	CASK	O14936	926 aa		9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	SMPD2	O60906	423 aa		9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	HAUS5	O94927	633 aa		9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	GOSR1	O95249	250 aa		9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	SERPINA6	P08185	405 aa		9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	CD53	P19397	219 aa		9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	AP1S2	P56377	157 aa		9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	WNT3	P56703	355 aa		9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB38	P57729	211 aa		9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	REEP5	Q00765	189 aa		9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	CCNG2	Q16589	344 aa		9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	LACC1	Q8IV20	430 aa		9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	NAXE	Q8NCW5	288 aa		9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	MORN4	Q8NDC4	146 aa		9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	OR56A3	Q8NH54	315 aa		9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	KIAA1191	Q96A73	305 aa		9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511		Q96MF0	132 aa		9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	OR4K3	Q96R72	315 aa		9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	SPNS1	Q9H2V7	528 aa		9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	TSPY26P	Q9H489	355 aa		9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	PELI2	Q9HAT8	420 aa		9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	PRR13	Q9NZ81	148 aa		9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	EIF3L	Q9Y262	564 aa	Known RBP	9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	VPS13C	Q709C8	3753 aa		9.96	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		9.95	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	AHRR	A9YTQ3	701 aa		9.95	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	C17orf105	B2RV13	164 aa		9.95	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	C4orf51	C9J302	202 aa		9.95	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	INAFM1	C9JVW0	142 aa		9.95	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	9.95	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	GDF1	P27539	372 aa		9.95	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	CPA2	P48052	419 aa		9.95	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	9.95	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	PLA2G16	P53816	162 aa		9.95	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	SORD	Q00796	357 aa		9.95	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	FOXO1	Q12778	655 aa		9.95	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	ASPH	Q12797	758 aa		9.95	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	RUNX2	Q13950	521 aa		9.95	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	9.95	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	9.95	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	ARMC3	Q5W041	872 aa		9.95	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		9.95	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		9.95	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	9.95	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		9.95	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		9.95	□□□□□ -0.82
SKAP2-209	ENST00000497511	BDH2	Q9BUT1	245 aa		9.95	□□□□□ -0.82

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