RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490800.1

CLDN1-202, Transcript of claudin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLDN1, Length 432 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN1-202ENST00000490800 SAP18O00422 153 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 AIM2O14862 343 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 TMPRSS2O15393 492 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 GYG2O15488 501 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 GSC2O15499 205 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 OR2B3O76000 313 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 MYO1DO94832 1006 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 KLHL18O94889 574 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 SEMA3DO95025 777 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 HTR3BO95264 441 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 HBQ1P09105 142 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 MSL3P1P0C860 447 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 DRD2P14416 443 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 ITGAXP20702 1163 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 MAGP20916 626 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 AGXTP21549 392 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 GSTM2P28161 218 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 GRK3P35626 688 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 AHRP35869 848 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 GABRA4P48169 554 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 CLDN8P56748 225 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 SLC25A3Q00325 362 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 STX5Q13190 355 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 RCAN2Q14206 197 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 PTGR1Q14914 329 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 DEFB110Q30KQ9 67 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 VPS26BQ4G0F5 336 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 NADK2Q4G0N4 442 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 SPIN4Q56A73 249 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 DEPDC1Q5TB30 811 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 C1orf189Q5VU69 101 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 FBXO42Q6P3S6 717 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 GALNT18Q6P9A2 607 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 COMMD6Q7Z4G1 85 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 VN1R4Q7Z5H5 301 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 UBE3DQ7Z6J8 389 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 GPR135Q8IZ08 494 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 DNAJC22Q8N4W6 341 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 TBC1D19Q8N5T2 526 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 TTLQ8NG68 377 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 CLHC1Q8NHS4 586 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 TSPEARQ8WU66 669 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 SPDL1Q96EA4 605 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 TSSK3Q96PN8 268 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 F2RL3Q96RI0 385 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 NPAS2Q99743 824 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 DPY30Q9C005 99 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 C1orf21Q9H246 121 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 ANKMY1Q9P2S6 941 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa7.13□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 FLNCQ14315 2725 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 A0A1W2PP18 115 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 LRIT2A6NDA9 550 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 BBIP1A8MTZ0 92 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 C9J4A7 227 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 H3BMH7 237 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 PLPP1O14494 284 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 MRASO14807 208 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 NDUFS4O43181 175 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 PCDH7O60245 1069 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 CTSVO60911 334 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 EEDO75530 441 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 CEACAM4O75871 244 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 STATHP02808 62 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 SERPIND1P05546 499 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 KLK1P06870 262 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 KRT16P08779 473 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 OTX2P32243 289 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 BSGP35613 385 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 CD97P48960 835 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 NUDT2P50583 147 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 PGDP52209 483 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 KCNK10P57789 538 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 FOXL2P58012 376 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 C21orf58P58505 322 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 DCDP81605 110 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 MXRA7P84157 204 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 RELAQ04206 551 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 RAPSNQ13702 412 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 NCF4Q15080 339 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 ADPRMQ3LIE5 342 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 DNAL1Q4LDG9 190 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 TIGD2Q4W5G0 525 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 COQ5Q5HYK3 327 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 RHBDD2Q6NTF9 364 aa7.12□□□□□ -1.27
CLDN1-202ENST00000490800 FAM198BQ6UWH4 519 aa7.12□□□□□ -1.27
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