RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 MACROD1Q9BQ69 325 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM129AQ9BZQ8 928 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 PCBD2Q9H0N5 130 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 MMP25Q9NPA2 562 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 AKIP1Q9NQ31 210 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 LANCL2Q9NS86 450 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 HOMER3Q9NSC5 361 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 TEKT2Q9UIF3 430 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 FBXO5Q9UKT4 447 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 SH2B3Q9UQQ2 575 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 PDE10AQ9Y233 779 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 CHST2Q9Y4C5 530 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC22A7Q9Y694 548 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 COMMD10Q9Y6G5 202 aa5.96□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 FEZF1A0PJY2 475 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 GAGE12BA1L429 117 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 GAGE12HA6NDE8 117 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 A8MUI8 341 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 MAGEB17A8MXT2 336 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 DIRC3C9JPN6 131 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 E5RI56 91 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 C19orf84I3L1E1 186 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 SGK494L7N484 410 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 ADAM10O14672 748 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC16A5O15375 505 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 DNAJB6O75190 326 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 TSPAN12O95859 305 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 STATHP02808 62 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 SP1P08047 785 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 IL1RNP18510 177 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 GABRB3P28472 473 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 COILP38432 576 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC1A2P43004 574 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 XCR1P46094 333 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 AGTR2P50052 363 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 CLRN1P58418 232 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 PMP22Q01453 160 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 RBPJQ06330 500 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF33BQ06732 778 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 EXT1Q16394 746 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 MEP1AQ16819 746 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 LONRF1Q17RB8 773 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 BTBD16Q32M84 506 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 FCRLBQ6BAA4 426 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 SPINK14Q6IE38 97 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC26A11Q86WA9 606 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 CRLF3Q8IUI8 442 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 LMNTD2Q8IXW0 634 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 RASGEF1CQ8N431 466 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 OTUD6BQ8N6M0 293 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 NAT8LQ8N9F0 302 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 MFSD9Q8NBP5 474 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 CAMKVQ8NCB2 501 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 SUN3Q8TAQ9 357 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 MCOLN3Q8TDD5 553 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 ELP5Q8TE02 316 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC13A3Q8WWT9 602 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 MOCOSQ96EN8 888 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 LURAP1Q96LR2 239 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 SERPINB12Q96P63 405 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 OR1F2PQ96R84 312 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 TRIM51Q9BSJ1 452 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 HES7Q9BYE0 225 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 PARVBQ9HBI1 364 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 MOCS1Q9NZB8 636 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 SCOCQ9UIL1 159 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 MEMO1Q9Y316 297 aa5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 NUP210LQ5VU65 1888 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 CTAGE9A4FU28 777 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 TTI1O43156 1089 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 ASNA1O43681 348 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 CEP104O60308 925 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 RDH16O75452 317 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 SYF2O95926 243 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 KRT14P02533 472 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 C8GP07360 202 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 SMIM10L1P0DMW3 83 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 RAP2AP10114 183 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 KRT4P19013 534 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 CXCR5P32302 372 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 CHN2P52757 468 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 CDKN2DP55273 166 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC26A5P58743 744 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 TBPL1P62380 186 aa5.94□□□□□ -1.46
PRPF40A-210ENST00000489741 MPP1Q00013 466 aa5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms