RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488990.5

TRDMT1-210, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRDMT1, Length 1,301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-210ENST00000488990 CYTH2Q99418 400 aa7□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 ZNF747Q9BV97 191 aa7□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 KIFC1Q9BW19 673 aa7□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 PITPNM3Q9BZ71 974 aa7□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP7□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 BFARQ9NZS9 450 aa7□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa7□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 COMMD10Q9Y6G5 202 aa7□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 NOTCH3Q9UM47 2321 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 A0A096LNT2 108 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 A0A0A6YYJ9 748 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 A0A1B0GX78 115 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 FAM159BA6NKW6 160 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 DEFB108AA8MXU0 73 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 J3KR12 359 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 SLC25A12O75746 678 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 ACSL3O95573 720 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 SHBGP04278 402 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 MMP2P08253 660 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 CA4P22748 312 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 CNTFP26441 200 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 IDUAP35475 653 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 ELK3P41970 407 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 OR1D4P47884 311 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 RPL26P61254 145 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 AP1S1P61966 158 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 VLDLRP98155 873 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 SLC10A7Q0GE19 358 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 PRKAA1Q13131 559 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 USP10Q14694 798 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 CRYMQ14894 314 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 KRT71Q3SY84 523 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 TTMPQ5BVD1 217 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 SPANXN3Q5MJ09 141 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 GARNL3Q5VVW2 1013 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 FIGLAQ6QHK4 219 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 NLRP9Q7RTR0 991 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 GALNT7Q86SF2 657 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 CRLF3Q8IUI8 442 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 ZNF547Q8IVP9 402 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 CNTN4Q8IWV2 1026 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 LMNTD2Q8IXW0 634 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 CDYL2Q8N8U2 506 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 OR4E2Q8NGC2 313 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 ZFAND2BQ8WV99 257 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 SLC44A1Q8WWI5 657 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 MTBPQ96DY7 904 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 ZNF354BQ96LW1 612 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 NUDCD1Q96RS6 583 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 NPAS2Q99743 824 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 NRTNQ99748 197 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 TBL1YQ9BQ87 522 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 TIMM29Q9BSF4 260 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 CNPPD1Q9BV87 410 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 FSD1LQ9BXM9 530 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 PLAC1Q9HBJ0 212 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 PSD3Q9NYI0 1048 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 KCMF1Q9P0J7 381 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 CHMP2BQ9UQN3 213 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 TTLL3Q9Y4R7 772 aa6.99□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.98□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 A0A1W2PQ67 120 aa6.98□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 CCDC189A1A4V9 331 aa6.98□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 C2orf81A6NN90 581 aa6.98□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 HSPB2A8KAH6 182 aa6.98□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 GABRR3A8MPY1 467 aa6.98□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 GOLGA8MH3BSY2 632 aa6.98□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 CHUKO15111 745 aa6.98□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 KMOO15229 486 aa6.98□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 PIN1P1O15428 100 aa6.98□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 KIAA0513O60268 411 aa6.98□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 SOCS5O75159 536 aa6.98□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 POLBP06746 335 aa6.98□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 TPH1P17752 444 aa6.98□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 HNF1AP20823 631 aa6.98□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 GCAP28676 217 aa6.98□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 SERPINB9P50453 376 aa6.98□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 ACVR1Q04771 509 aa6.98□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 NIPAL4Q0D2K0 466 aa6.98□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 ZIC1Q15915 447 aa6.98□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 HSPB2Q16082 182 aa6.98□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 ETFDHQ16134 617 aa6.98□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 PCID2Q5JVF3 399 aa6.98□□□□□ -1.29
TRDMT1-210ENST00000488990 CYB5R2Q6BCY4 276 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms