RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488629.5

GIGYF2-240, Transcript of GRB10 interacting GYF protein 2, human

TSL 4

Gene GIGYF2, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GIGYF2-240	ENST00000488629	FUT1	P19526	365 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	DNAJB1	P25685	340 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	PKLR	P30613	574 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	ID1	P41134	155 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	NDST2	P52849	883 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	P2RY14	Q15391	338 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	AGK	Q53H12	422 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	C1orf189	Q5VU69	101 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	SYVN1	Q86TM6	617 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	TEX9	Q8N6V9	391 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	RNF148	Q8N7C7	305 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	PHYHIP	Q92561	330 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	TMEM45B	Q96B21	275 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	ART5	Q96L15	291 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	AURKC	Q9UQB9	309 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	MPTX1	A8MV57	137 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	EDIL3	O43854	480 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	FH	P07954	510 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	CCND2	P30279	289 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	NUMB	P49757	651 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	PEX3	P56589	373 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	MYBPC1	Q00872	1141 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	DPYS	Q14117	519 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	SLC17A1	Q14916	467 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	IL23R	Q5VWK5	629 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	OLFM4	Q6UX06	510 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629		Q6ZTC4	211 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	DEFB118	Q96PH6	123 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	NACA2	Q9H009	215 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	CHD4	Q14839	1912 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	NOTCH4	Q99466	2003 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	MEI4	A8MW99	385 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629		K7EPI3	171 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	SH2D1B	O14796	132 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	IFNB1	P01574	187 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	RALA	P11233	206 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	CD1D	P15813	335 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	FCGR2C	P31995	323 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	NPY2R	P49146	381 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	CRYBA2	P53672	197 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	ERVK-16	P61578	105 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	CDKL1	Q00532	357 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	NME3	Q13232	169 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	SNX1	Q13596	522 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	PDIA5	Q14554	519 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	ZNF329	Q86UD4	541 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	KCNMB4	Q86W47	210 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	ZNF614	Q8N883	585 aa		4.35	□□□□□ -1.71
GIGYF2-240	ENST00000488629	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		4.35	□□□□□ -1.71

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