RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 ZBED5Q49AG3 693 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 C6orf141Q5SZD1 244 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 FHL5Q5TD97 284 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 MLIPQ5VWP3 458 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 KRT80Q6KB66 452 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 REEP3Q6NUK4 255 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 FAM180BQ6P0A1 224 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 Q7L0L9 218 aa5.33□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 C6orf120Q7Z4R8 191 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 TRIM73Q86UV7 250 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 OR13F1Q8NGS4 319 aa5.33□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 PATE1Q8WXA2 126 aa5.33□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 SLC22A18Q96BI1 424 aa5.33□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 NLNQ9BYT8 704 aa5.33□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 NUP210LQ5VU65 1888 aa5.32□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 GON4LQ3T8J9 2241 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa5.32□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa5.32□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 H3BSA7 217 aa5.32□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 BCKDKO14874 412 aa5.32□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 ATP6V1B1P15313 513 aa5.32□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 ITIH1P19827 911 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 AGXTP21549 392 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 PCMT1P22061 227 aa5.32□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 DCKP27707 260 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 PCSK6P29122 969 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 AQP1P29972 269 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 GSTT1P30711 240 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 RRM2P31350 389 aa5.32□□□□□ -1.56
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