RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 DCAF10Q5QP82 559 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 LANCL3Q6ZV70 420 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 IKBIPQ70UQ0 350 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 DNAJB14Q8TBM8 379 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 TUBB6Q9BUF5 446 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 AKTIPQ9H8T0 292 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 MYNNQ9NPC7 610 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 KCNMB2Q9Y691 235 aa9.93□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 ARGFXA6NJG6 315 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 GLOD5A6NK44 160 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 PGRMC2O15173 223 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 FGF17O60258 216 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 LDB3O75112 727 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 IL3P08700 152 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 PRPS2P11908 318 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 COX6A1P12074 109 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 ICAM2P13598 275 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 PIK3R1P27986 724 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 FOLH1Q04609 750 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 EMX2Q04743 252 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 PCOLCEQ15113 449 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC48A1Q6P1K1 146 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 FNDC5Q8NAU1 212 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 CLEC1AQ8NC01 280 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 OR4K14Q8NGD5 310 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP9.92□□□□□ -0.828e-7■■■■■ 41.5
RABGEF1-205ENST00000450873 PPP1R36Q96LQ0 422 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 LPAR4Q99677 370 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 ING2Q9H160 280 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 CLDN16Q9Y5I7 305 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 USH1CQ9Y6N9 552 aa9.92□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 TCP11X1B4DZS4 312 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 SDHDO14521 159 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 ATP5HO75947 161 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 TGDSO95455 350 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 IFNA16P05015 189 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 PRR35P0CG20 571 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 LBPP18428 481 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 ASMTP46597 345 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 ALDH9A1P49189 494 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 AP2B1P63010 937 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 TLE1Q04724 770 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 C2orf80Q0P641 193 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM71E1Q6IPT2 247 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 OR4N5Q8IXE1 308 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 UCN3Q969E3 161 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 MESP1Q9BRJ9 268 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 ADAP2Q9NPF8 381 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 EHD3Q9NZN3 535 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 GIMAP2Q9UG22 337 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 ANAPC2Q9UJX6 822 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 CES1P1Q9UKY3 287 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 SCN2AQ99250 2005 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 TGFBR3LH3BV60 316 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 BCKDHAP12694 445 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 PCSK2P16519 638 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 SDC1P18827 310 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 DDCP20711 480 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 ERVK-8P63133 956 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 ID2Q02363 134 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 EXT1Q16394 746 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 IL23RQ5VWK5 629 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM47EQ6ZV65 393 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 CDC26Q8NHZ8 85 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 IMMP1LQ96LU5 166 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 DGAT2Q96PD7 388 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF160Q9HCG1 818 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 ASIC5Q9NY37 505 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 HEY2Q9UBP5 337 aa9.91□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 WASHC1A8K0Z3 465 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF195O14628 629 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 EDF1O60869 148 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC35E2P0CK97 266 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 COX7A2P14406 83 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 TNNI3P19429 210 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 ATP6V1C1P21283 382 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 TACR1P25103 407 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 STT3AP46977 705 aa9.9□□□□□ -0.82
RABGEF1-205ENST00000450873 XKP51811 444 aa9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms