RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449058.6

TOM1-210, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOM1, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1-210	ENST00000449058	SMARCD2	Q92925	531 aa		16.03	■□□□□ 0.16
TOM1-210	ENST00000449058	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		16.03	■□□□□ 0.16
TOM1-210	ENST00000449058	AICDA	Q9GZX7	198 aa		16.03	■□□□□ 0.16
TOM1-210	ENST00000449058	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		16.03	■□□□□ 0.16
TOM1-210	ENST00000449058	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		16.03	■□□□□ 0.16
TOM1-210	ENST00000449058	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	16.03	■□□□□ 0.16
TOM1-210	ENST00000449058	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		16.03	■□□□□ 0.16
TOM1-210	ENST00000449058	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		16.03	■□□□□ 0.16
TOM1-210	ENST00000449058	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		16.03	■□□□□ 0.16
TOM1-210	ENST00000449058	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	16.03	■□□□□ 0.16
TOM1-210	ENST00000449058	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	16.03	■□□□□ 0.16
TOM1-210	ENST00000449058	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		16.02	■□□□□ 0.16
TOM1-210	ENST00000449058	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		16.02	■□□□□ 0.16
TOM1-210	ENST00000449058	AQP9	O43315	295 aa		16.02	■□□□□ 0.16
TOM1-210	ENST00000449058	KIAA0513	O60268	411 aa		16.02	■□□□□ 0.16
TOM1-210	ENST00000449058	OR10H3	O60404	316 aa		16.02	■□□□□ 0.16
TOM1-210	ENST00000449058	SOX14	O95416	240 aa		16.02	■□□□□ 0.16
TOM1-210	ENST00000449058	OR12D1	P0DN82	309 aa		16.02	■□□□□ 0.16
TOM1-210	ENST00000449058	DRD2	P14416	443 aa		16.02	■□□□□ 0.16
TOM1-210	ENST00000449058	CD72	P21854	359 aa		16.02	■□□□□ 0.16
TOM1-210	ENST00000449058	RHAG	Q02094	409 aa		16.02	■□□□□ 0.16
TOM1-210	ENST00000449058	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		16.02	■□□□□ 0.16
TOM1-210	ENST00000449058	STEAP3	Q658P3	488 aa		16.02	■□□□□ 0.16
TOM1-210	ENST00000449058	CYP4Z2P	Q8N1L4	340 aa		16.02	■□□□□ 0.16
TOM1-210	ENST00000449058	TBC1D19	Q8N5T2	526 aa		16.02	■□□□□ 0.16
TOM1-210	ENST00000449058	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		16.02	■□□□□ 0.16
TOM1-210	ENST00000449058	DPH7	Q9BTV6	452 aa		16.02	■□□□□ 0.16
TOM1-210	ENST00000449058	OR51I1	Q9H343	314 aa		16.02	■□□□□ 0.16
TOM1-210	ENST00000449058	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		16.02	■□□□□ 0.16
TOM1-210	ENST00000449058	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		16.02	■□□□□ 0.16
TOM1-210	ENST00000449058	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		16.02	■□□□□ 0.16
TOM1-210	ENST00000449058	EHD3	Q9NZN3	535 aa		16.02	■□□□□ 0.16
TOM1-210	ENST00000449058	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		16.02	■□□□□ 0.16
TOM1-210	ENST00000449058	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		16.02	■□□□□ 0.16
TOM1-210	ENST00000449058	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	16.02	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	S100A5	P33763	92 aa		16.02	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	16.02	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	DMPK	Q09013	629 aa		16.02	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	16.02	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	COMTD1	Q86VU5	262 aa		16.02	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		16.02	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	16.02	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		16.02	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		16.02	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	OPALIN	Q96PE5	141 aa		16.02	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	16.02	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		16.02	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		16.02	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	LAMA3	Q16787	3333 aa		16.02	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	LRIT2	A6NDA9	550 aa		16.01	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		16.01	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	PPM1D	O15297	605 aa		16.01	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	TBX1	O43435	398 aa		16.01	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	ATP6V1G1	O75348	118 aa		16.01	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	GPR89B	P0CG08	455 aa		16.01	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	16.01	■□□□□ 0.15	1e-6	■■■■□ 21
TOM1-210	ENST00000449058	ETV6	P41212	452 aa		16.01	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	XK	P51811	444 aa		16.01	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	PRDX1	Q06830	199 aa	Known RBP	16.01	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	AGER	Q15109	404 aa		16.01	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		16.01	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	AGBL4	Q5VU57	503 aa		16.01	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		16.01	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		16.01	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		16.01	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	BAD	Q92934	168 aa		16.01	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	16.01	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	16.01	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	INIP	Q9NRY2	104 aa		16.01	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	MKLN1	Q9UL63	735 aa		16.01	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		16.01	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058		A0A0G2JN53	185 aa		16.01	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058		A0A1W2PRQ8	180 aa		16.01	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	SCG5	P05408	212 aa		16.01	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	SLC13A2	Q13183	592 aa		16.01	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	NCF4	Q15080	339 aa		16.01	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	PDGFRL	Q15198	375 aa		16.01	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		16.01	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	16.01	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		16.01	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		16.01	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	SLC6A18	Q96N87	628 aa		16.01	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	16.01	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		16.01	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		16.01	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	HHATL	Q9HCP6	504 aa		16.01	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		16.01	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		16.01	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	CFL2	Q9Y281	166 aa		16.01	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	GPX5	O75715	221 aa		16	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	SSR2	P43308	183 aa		16	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	MAGEA8	P43361	318 aa		16	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	16	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	ZIC1	Q15915	447 aa		16	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	OCLN	Q16625	522 aa		16	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	RNLS	Q5VYX0	342 aa		16	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	CASP12	Q6UXS9	341 aa		16	■□□□□ 0.15
TOM1-210	ENST00000449058	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		16	■□□□□ 0.15

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.4 ms