RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM132DQ14C87 1099 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 ECM1Q16610 540 aa5.37□□□□□ -1.55
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PTPRC-209ENST00000442510 GTDC1Q4AE62 458 aa5.37□□□□□ -1.55
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PTPRC-209ENST00000442510 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 NCEH1Q6PIU2 408 aa5.37□□□□□ -1.55
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PTPRC-209ENST00000442510 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
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PTPRC-209ENST00000442510 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
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PTPRC-209ENST00000442510 PDE6DO43924 150 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 TPT1P13693 172 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 TYRP14679 529 aa5.36□□□□□ -1.55
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PTPRC-209ENST00000442510 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
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PTPRC-209ENST00000442510 CHATP28329 748 aa5.36□□□□□ -1.55
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PTPRC-209ENST00000442510 ARL4AP40617 200 aa5.36□□□□□ -1.55
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PTPRC-209ENST00000442510 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
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PTPRC-209ENST00000442510 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 OR5B2Q96R09 309 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 MCOLN1Q9GZU1 580 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 ATG5Q9H1Y0 275 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 RIOX1Q9H6W3 641 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 KANSL3Q9P2N6 904 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM59LQ9UK28 342 aa5.36□□□□□ -1.55
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