RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 NT5EP21589 574 aa16.75■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 CYB561P49447 251 aa16.75■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 RNF4P78317 190 aa16.75■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 CHI3L2Q15782 390 aa16.75■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 ZNF766Q5HY98 468 aa16.75■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 RNF165Q6ZSG1 346 aa16.75■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 HOMEZQ8IX15 550 aa16.75■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 HORMAD2Q8N7B1 307 aa16.75■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 ANKRD42Q8N9B4 389 aa16.75■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 MDS2Q8NDY4 140 aa16.75■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 OR5L2Q8NGL0 311 aa16.75■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 OR8K3Q8NH51 312 aa16.75■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 TWIST2Q8WVJ9 160 aa16.75■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 KLHL29Q96CT2 875 aa16.75■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 MYOTQ9UBF9 498 aa16.75■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 PSME2Q9UL46 239 aa16.75■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 VPS4AQ9UN37 437 aa16.75■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 WWP2O00308 870 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 SEC22BO75396 215 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 NEURL1O76050 574 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 LINC00032P0C843 101 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 DRD2P14416 443 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 CD46P15529 392 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 PORP16435 677 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 PRPH2P23942 346 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 FEN1P39748 380 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 GSTM5P46439 218 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 HLCSP50747 726 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 HK2P52789 917 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 ZNF763Q0D2J5 394 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 HEPACAMQ14CZ8 416 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 UGT3A2Q3SY77 523 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 FAM180BQ6P0A1 224 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 Q6ZSR9 355 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 GALNT12Q8IXK2 581 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 DDIASQ8IXT1 998 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 TMEM156Q8N614 296 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 OR2T11Q8NH01 316 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 CDC26Q8NHZ8 85 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 FAM76AQ8TAV0 307 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 GRHL3Q8TE85 626 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 C5orf34Q96MH7 638 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 HES7Q9BYE0 225 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 CXorf21Q9HAI6 301 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 LRTM1Q9HBL6 345 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 KLHL1Q9NR64 748 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP16.74■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 C1orf109Q9NX04 203 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 UTS2RQ9UKP6 389 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa16.74■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 NPIPB8E9PQR5 432 aa16.73■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 PIP5K1BO14986 540 aa16.73■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 OR2J2O76002 312 aa16.73■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 HSPA4LO95757 839 aa16.73■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 SERPINE1P05121 402 aa16.73■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 CT62P0C5K7 136 aa16.73■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 NEFHP12036 1026 aa16.73■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 SSR4P51571 173 aa16.73■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
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HERC3-205ENST00000426683 KIAA0040Q15053 153 aa16.73■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 NR6A1Q15406 480 aa16.73■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 INAQ16352 499 aa16.73■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 C6orf163Q5TEZ5 329 aa16.73■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 CES4AQ5XG92 561 aa16.73■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 SLC25A25Q6KCM7 469 aa16.73■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 NOXRED1Q6NXP6 359 aa16.73■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 FAM180AQ6UWF9 173 aa16.73■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 RNF111Q6ZNA4 994 aa16.73■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 C9orf40Q8IXQ3 194 aa16.73■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 GALNT11Q8NCW6 608 aa16.73■□□□□ 0.27
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HERC3-205ENST00000426683 SCMH1Q96GD3 660 aa16.73■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 PFDN4Q9NQP4 134 aa16.73■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 TMEM120BA0PK00 339 aa16.72■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 TMEM114B3SHH9 223 aa16.72■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 TCP11X1B4DZS4 312 aa16.72■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 ITM2AO43736 263 aa16.72■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 SLC25A12O75746 678 aa16.72■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 RASAL1O95294 804 aa16.72■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 CLPSP04118 112 aa16.72■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 SP1P08047 785 aa16.72■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 BGNP21810 368 aa16.72■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 GNLYP22749 145 aa16.72■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 SSTR4P31391 388 aa16.72■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 SLC37A1P57057 533 aa16.72■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 DUSP2Q05923 314 aa16.72■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 C2orf80Q0P641 193 aa16.72■□□□□ 0.27
HERC3-205ENST00000426683 HHATQ5VTY9 493 aa16.72■□□□□ 0.27
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