RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415409.5

HDAC8-211, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC8, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-211ENST00000415409 SAXO2Q658L1 398 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 C18orf63Q68DL7 685 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 OR52E8Q6IFG1 317 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 TMEM64Q6YI46 380 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 FAM92BQ6ZTR7 304 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 C6orf120Q7Z4R8 191 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 RNF130Q86XS8 419 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 PLXDC1Q8IUK5 500 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 KBTBD2Q8IY47 623 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 CLEC4FQ8N1N0 589 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 SLC25A45Q8N413 288 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 DNAJC22Q8N4W6 341 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 PACRGLQ8N7B6 248 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 DTWD2Q8NBA8 298 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 OR4K14Q8NGD5 310 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 OR6C4Q8NGE1 309 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 OR56A1Q8NGH5 318 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 OR5AK3PQ8NH89 298 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 PSMA8Q8TAA3 256 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 CEP76Q8TAP6 659 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 SFXN5Q8TD22 340 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 LZICQ8WZA0 190 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 PIGKQ92643 395 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 SDCCAG3Q96C92 435 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 NEURL3Q96EH8 262 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 AMDHD1Q96NU7 426 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 TGM7Q96PF1 710 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 BTBD9Q96Q07 612 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 MAP3K3Q99759 626 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 DUSP23Q9BVJ7 150 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 GLIPR2Q9H4G4 154 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 TMEM38AQ9H6F2 299 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 EPS8L2Q9H6S3 715 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 SYNPO2LQ9H987 977 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 C3orf14Q9HBI5 128 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 ANKHQ9HCJ1 492 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 PDE7BQ9NP56 450 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 SLAMF7Q9NQ25 335 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 IRAK4Q9NWZ3 460 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 ADPRHL2Q9NX46 363 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 NLGN3Q9NZ94 848 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 C5AR2Q9P296 337 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 DNAJB9Q9UBS3 223 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 PILRBQ9UKJ0 227 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 ACSL6Q9UKU0 697 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 BAG5Q9UL15 447 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 CLCA2Q9UQC9 943 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 ANGPT4Q9Y264 503 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 LRCH1Q9Y2L9 728 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 TRPM6Q9BX84 2022 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 FAM186AA6NE01 2351 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 A0A1B0GTQ1 180 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 FAM149AA5PLN7 773 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 FAM86C2PA6NEL3 165 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 SAC3D1A6NKF1 404 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 M0R082 166 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 EMC8O43402 210 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 SUV39H1O43463 412 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 BMP10O95393 424 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 CST1P01037 141 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 CFIP05156 583 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 FHP07954 510 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 RPSAP08865 295 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 UQCRBP14927 111 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 HOXD12P35452 270 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 FEN1P39748 380 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 KHKP50053 298 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 CDK9P50750 372 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 CCT8P50990 548 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 XKP51811 444 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 MVDP53602 400 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 AQP4P55087 323 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 LIM2P55344 173 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 OR1D5P58170 312 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 PRR5P85299 388 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 CDK6Q00534 326 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 BNC1Q01954 994 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 MED21Q13503 144 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 TP53BP2Q13625 1128 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 RUNX2Q13950 521 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 GNA13Q14344 377 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 NR0B2Q15466 257 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 ADRM1Q16186 407 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 PRTGQ2VWP7 1150 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 DEFB110Q30KQ9 67 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 AMZ1Q400G9 498 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 SFT2D3Q587I9 215 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 COX20Q5RI15 118 aa6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms