RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 GRB7Q14451 532 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 ABRAXAS2Q15018 415 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 RPS6KA2Q15349 733 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 PIGGQ5H8A4 983 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 PAGE2BQ5JRK9 111 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 C6orf136Q5SQH8 315 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 CACHD1Q5VU97 1274 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 FRG2Q64ET8 278 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 AAGABQ6PD74 315 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 Q6ZSR9 355 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 FBXW8Q8N3Y1 598 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 OR9I1Q8NGQ6 314 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 OR14C36Q8NHC7 312 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 GANCQ8TET4 914 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 STARD8Q92502 1023 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 ESAMQ96AP7 390 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 RAD51AP1Q96B01 352 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 ASB9Q96DX5 294 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 SPDL1Q96EA4 605 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 WDR34Q96EX3 536 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 SIPA1Q96FS4 1042 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 FCRL1Q96LA6 429 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 FRG2BQ96QU4 278 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 ZBTB18Q99592 522 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 EFCAB11Q9BUY7 163 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 MLST8Q9BVC4 326 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 SLC25A18Q9H1K4 315 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 MUC13Q9H3R2 512 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 IFT22Q9H7X7 185 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 BRF2Q9HAW0 419 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 LRTM1Q9HBL6 345 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 SGK2Q9HBY8 427 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 THSD1Q9NS62 852 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 C1orf109Q9NX04 203 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 ABCD2Q9UBJ2 740 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 KLQ9UEF7 1012 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 ACSL5Q9ULC5 683 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 CCL27Q9Y4X3 112 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 KCNE2Q9Y6J6 123 aa6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa6.22□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 A0A1W2PP18 115 aa6.22□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 CCDC154A6NI56 674 aa6.22□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 LRRC72A6NJI9 287 aa6.22□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 C10orf142B7Z368 130 aa6.22□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 E7EQ34 232 aa6.22□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 FXYD1O00168 92 aa6.22□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 TRIM38O00635 465 aa6.22□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 CFLARO15519 480 aa6.22□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 ENTPD5O75356 428 aa6.22□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 CSO75390 466 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 SLC22A3O75751 556 aa6.22□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 PDE5AO76074 875 aa6.22□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 PSMG1O95456 288 aa6.22□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 SLC16A8O95907 504 aa6.22□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 ACADMP11310 421 aa6.22□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 PRPS2P11908 318 aa6.22□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 CKMT2P17540 419 aa6.22□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 WT1P19544 449 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 ACP1P24666 158 aa6.22□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 ACADLP28330 430 aa6.22□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 CASP2P42575 452 aa6.22□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 UQCRFS1P47985 274 aa6.22□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 THOP1P52888 689 aa6.22□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 DIO3P55073 304 aa6.22□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 C21orf58P58505 322 aa6.22□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 PSME3P61289 254 aa6.22□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 AP2B1P63010 937 aa6.22□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 CYP4F2P78329 520 aa6.22□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 PHEXP78562 749 aa6.22□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 IRF8Q02556 426 aa6.22□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 BNIP2Q12982 314 aa6.22□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 CHIT1Q13231 466 aa6.22□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 ILKQ13418 452 aa6.22□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 FGL2Q14314 439 aa6.22□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 NFE2L1Q14494 772 aa6.22□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 RCN1Q15293 331 aa6.22□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 TGIF1Q15583 401 aa6.22□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 AP5B1Q2VPB7 878 aa6.22□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 C3orf38Q5JPI3 329 aa6.22□□□□□ -1.41
CCL20-202ENST00000409189 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms