RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389413.7

PTPRN2-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN2, Length 4,723 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-201ENST00000389413 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 UGT3A2Q3SY77 523 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 XKR7Q5GH72 579 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 Q8N402 240 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 FANK1Q8TC84 345 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 PIGKQ92643 395 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC38A3Q99624 504 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 CHIAQ9BZP6 476 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 CWH43Q9H720 699 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 CDK1P06493 297 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 CSF2RAP15509 400 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 MAP2K3P46734 347 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 UAP1L1Q3KQV9 507 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 TBC1D15Q8TC07 691 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 UBTD2Q8WUN7 234 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 SGIP1Q9BQI5 828 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 Q9N2J8 555 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 KLKB1P03952 638 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 GIMD1P0DJR0 217 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 PTNP21246 168 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 AHCYP23526 432 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 IL12BP29460 328 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC9A3P48764 834 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 TAS2R38P59533 333 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 PLAG1Q6DJT9 500 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 FAM180BQ6P0A1 224 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 DPH7Q9BTV6 452 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 HCSTQ9UBK5 93 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 UPB1Q9UBR1 384 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 SCN9AQ15858 1988 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 TARM1B6A8C7 271 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 GCGRP47871 477 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 MTNR1AP48039 350 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 TOMM20Q15388 145 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 AAK1Q2M2I8 961 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 TMEM107Q6UX40 140 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 OR52P1PQ8NH57 321 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 HSFX1Q9UBD0 423 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 HSPB11Q9Y547 144 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 CTSAP10619 480 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 STOMP27105 288 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 CCDC157Q569K6 752 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 KRT77Q7Z794 578 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 C15orf40Q8WUR7 153 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 MTG2Q9H4K7 406 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 CDH10Q9Y6N8 788 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC35F4A4IF30 521 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 MC1RQ01726 317 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 ID2Q02363 134 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 FAM26DQ5JW98 314 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC39A11Q8N1S5 342 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 SAMD12Q8N8I0 201 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 PPP1R14AQ96A00 147 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 OR51E2Q9H255 320 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 LINC00597Q9H2U6 94 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 MVB12BQ9H7P6 319 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 AGAP5A6NIR3 686 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 SYN1P17600 705 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 SNX29P2Q8IUI4 249 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 RNF175Q8N4F7 328 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 CHST4Q8NCG5 386 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 B3GNT7Q8NFL0 401 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 DGAT2Q96PD7 388 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 OR2B2Q9GZK3 357 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 KATNBL1Q9H079 304 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 COL24A1Q17RW2 1714 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 A0A1W2PRQ8 180 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 TMEM150CB9EJG8 249 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 HK3P52790 923 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 CTSCP53634 463 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 RPA4Q13156 261 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 AFMIDQ63HM1 303 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 PROKR2Q8NFJ6 384 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 PELI2Q9HAT8 420 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 MYNNQ9NPC7 610 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 ERVK-11Q9UQG0 969 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 IGLON5A6NGN9 336 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 MGAT3Q09327 533 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF527Q8NB42 609 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 PLAC1Q9HBJ0 212 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 C5AR2Q9P296 337 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 A0A0G2JPF8 293 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRN2-201ENST00000389413 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms