RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371146.5

USP1-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene USP1, Length 3,507 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP1-202ENST00000371146 STMN3Q9NZ72 180 aa6.66□□□□□ -1.34
USP1-202ENST00000371146 STOML1Q9UBI4 398 aa6.66□□□□□ -1.34
USP1-202ENST00000371146 REV1Q9UBZ9 1251 aa6.66□□□□□ -1.34
USP1-202ENST00000371146 PSME2Q9UL46 239 aa6.66□□□□□ -1.34
USP1-202ENST00000371146 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa6.66□□□□□ -1.34
USP1-202ENST00000371146 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
USP1-202ENST00000371146 AP3M1Q9Y2T2 418 aa6.66□□□□□ -1.34
USP1-202ENST00000371146 CACNG2Q9Y698 323 aa6.66□□□□□ -1.34
USP1-202ENST00000371146 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa6.66□□□□□ -1.34
USP1-202ENST00000371146 TSPAN11A1L157 253 aa6.65□□□□□ -1.34
USP1-202ENST00000371146 NR5A2O00482 541 aa6.65□□□□□ -1.34
USP1-202ENST00000371146 TDGF1P13385 188 aa6.65□□□□□ -1.34
USP1-202ENST00000371146 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
USP1-202ENST00000371146 DRD4P21917 467 aa6.65□□□□□ -1.34
USP1-202ENST00000371146 PKLRP30613 574 aa6.65□□□□□ -1.34
USP1-202ENST00000371146 BCL6P41182 706 aa6.65□□□□□ -1.34
USP1-202ENST00000371146 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
USP1-202ENST00000371146 AQP5P55064 265 aa6.65□□□□□ -1.34
USP1-202ENST00000371146 FOXA1P55317 472 aa6.65□□□□□ -1.34
USP1-202ENST00000371146 AP1S2P56377 157 aa6.65□□□□□ -1.34
USP1-202ENST00000371146 CFHR1Q03591 330 aa6.65□□□□□ -1.34
USP1-202ENST00000371146 ATP1A4Q13733 1029 aa6.65□□□□□ -1.34
USP1-202ENST00000371146 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
USP1-202ENST00000371146 TBCCQ15814 346 aa6.65□□□□□ -1.34
USP1-202ENST00000371146 CPZQ66K79 652 aa6.65□□□□□ -1.34
USP1-202ENST00000371146 C18orf63Q68DL7 685 aa6.65□□□□□ -1.34
USP1-202ENST00000371146 ALG1LQ6GMV1 187 aa6.65□□□□□ -1.34
USP1-202ENST00000371146 NXPE4Q6UWF7 544 aa6.65□□□□□ -1.34
USP1-202ENST00000371146 TMPRSS12Q86WS5 348 aa6.65□□□□□ -1.34
USP1-202ENST00000371146 MMP21Q8N119 569 aa6.65□□□□□ -1.34
USP1-202ENST00000371146 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
USP1-202ENST00000371146 DCAKDQ8WVC6 231 aa6.65□□□□□ -1.34
USP1-202ENST00000371146 RASSF5Q8WWW0 418 aa6.65□□□□□ -1.34
USP1-202ENST00000371146 SLC39A7Q92504 469 aa6.65□□□□□ -1.34
USP1-202ENST00000371146 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa6.65□□□□□ -1.34
USP1-202ENST00000371146 SLC25A23Q9BV35 468 aa6.65□□□□□ -1.34
USP1-202ENST00000371146 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
USP1-202ENST00000371146 DPY30Q9C005 99 aa6.65□□□□□ -1.34
USP1-202ENST00000371146 TRIM15Q9C019 465 aa6.65□□□□□ -1.34
USP1-202ENST00000371146 VPS4AQ9UN37 437 aa6.65□□□□□ -1.34
USP1-202ENST00000371146 PADI2Q9Y2J8 665 aa6.65□□□□□ -1.34
USP1-202ENST00000371146 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa6.65□□□□□ -1.34
USP1-202ENST00000371146 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa6.65□□□□□ -1.34
USP1-202ENST00000371146 AZIN1O14977 448 aa6.65□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 SCO2O43819 266 aa6.65□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 DNAJB6O75190 326 aa6.65□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 IFNA14P01570 189 aa6.65□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 NPPBP16860 134 aa6.65□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 FDXRP22570 491 aa6.65□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 RPA4Q13156 261 aa6.65□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 ACAP2Q15057 778 aa6.65□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 FRG2Q64ET8 278 aa6.65□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 ABHD13Q7L211 337 aa6.65□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 C10orf53Q8N6V4 93 aa6.65□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 OR7G3Q8NG95 312 aa6.65□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 DNAJB14Q8TBM8 379 aa6.65□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 SLC26A7Q8TE54 656 aa6.65□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 KIAA1191Q96A73 305 aa6.65□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 FRG2BQ96QU4 278 aa6.65□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 OR2A14Q96R47 310 aa6.65□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 RANBP9Q96S59 729 aa6.65□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 C9orf16Q9BUW7 83 aa6.65□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 SLC12A9Q9BXP2 914 aa6.65□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa6.65□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 CD244Q9BZW8 370 aa6.65□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 TMEM185BQ9H7F4 350 aa6.65□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 MARCH7Q9H992 704 aa6.65□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa6.65□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 LHX9Q9NQ69 397 aa6.65□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 NMRK1Q9NWW6 199 aa6.65□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 MALT1Q9UDY8 824 aa6.65□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 SLC13A4Q9UKG4 626 aa6.65□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 AIM2O14862 343 aa6.64□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 PIP5K1BO14986 540 aa6.64□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 ITM2AO43736 263 aa6.64□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 TSC22D2O75157 780 aa6.64□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 KRT16P08779 473 aa6.64□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 TFPTP0C1Z6 253 aa6.64□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 ETS2P15036 469 aa6.64□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 CLK3P49761 638 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 GNG2P59768 71 aa6.64□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 BEND4Q6ZU67 534 aa6.64□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 GPR141Q7Z602 305 aa6.64□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 PIGWQ7Z7B1 504 aa6.64□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 SPACA3Q8IXA5 215 aa6.64□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 IQCKQ8N0W5 287 aa6.64□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 FAM174AQ8TBP5 190 aa6.64□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 CT55Q8WUE5 264 aa6.64□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 RHBDF1Q96CC6 855 aa6.64□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 MTBPQ96DY7 904 aa6.64□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 TCTN2Q96GX1 697 aa6.64□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 SLC46A1Q96NT5 459 aa6.64□□□□□ -1.35
USP1-202ENST00000371146 DGAT2Q96PD7 388 aa6.64□□□□□ -1.35
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