RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368507.7

ROS1-201, Transcript of ROS proto-oncogene 1, receptor tyrosine kinase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene ROS1, Length 7,417 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROS1-201ENST00000368507 SOX30O94993 753 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 PNPP00491 289 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 UQCRC1P31930 480 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 CTHP32929 405 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 EPHA5P54756 1037 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 ARL16Q0P5N6 197 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 SLAMF1Q13291 335 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 GNMTQ14749 295 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 DPPA2Q7Z7J5 298 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 PPP1R3BQ86XI6 285 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 SCCPDHQ8NBX0 429 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 OR10T2Q8NGX3 314 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 THAP4Q8WY91 577 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 HAS1Q92839 578 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 MOCOSQ96EN8 888 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 C12orf42Q96LP6 360 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 SMOC2Q9H3U7 446 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 C12orf10Q9HB07 376 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 POT1Q9NUX5 634 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 PNPOQ9NVS9 261 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 B3GNT2Q9NY97 397 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 GDE1Q9NZC3 331 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 FLRT1Q9NZU1 646 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 POLHQ9Y253 713 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 WIF1Q9Y5W5 379 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 DNAJB5O75953 348 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 HLA-DQB2P05538 268 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 H1F0P07305 194 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 IL3RAP26951 378 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 KCNQ1P51787 676 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 SLC25A3Q00325 362 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 ZNF92Q03936 586 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 IL10RAQ13651 578 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 OR8B8Q15620 311 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 CA9Q16790 459 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 RHOUQ7L0Q8 258 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 CMC1Q7Z7K0 106 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 SLC51BQ86UW2 128 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 PRR18Q8N4B5 295 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 ESX1Q8N693 406 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 C3orf58Q8NDZ4 430 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 MDGA1Q8NFP4 955 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 MFSD8Q8NHS3 518 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 CLEC4DQ8WXI8 215 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 KATNBL1Q9H079 304 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 RLIMQ9NVW2 624 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 LTBP3Q9NS15 1303 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 LOC100509620A0A075B734 347 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 OR5H15A6NDH6 313 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 OR5H14A6NHG9 310 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 OR5H1A6NKK0 313 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 D6RAR5 112 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 TSTD3H0UI37 97 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 SOCS5O75159 536 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 FAM163BP0C2L3 166 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 HOXA9P31269 272 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 PXNP49023 591 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 VASPP50552 380 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 GPR85P60893 370 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 ECM1Q16610 540 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 NADK2Q4G0N4 442 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 GLT8D1Q68CQ7 371 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 NUP43Q8NFH3 380 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 SGTBQ96EQ0 304 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 DNAJA3Q96EY1 480 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 CHIAQ9BZP6 476 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 GAREM1Q9H706 876 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 PEX16Q9Y5Y5 336 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 ALG5Q9Y673 324 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 TLR4O00206 839 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 PRRG2O14669 202 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 VILLO15195 856 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 PRAMEF10O60809 474 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 CLPXO76031 633 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 ASGR2P07307 311 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 MMP2P08253 660 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 CTSAP10619 480 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 UQCRC2P22695 453 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 TLE3Q04726 772 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 MTX3Q5HYI7 312 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 GPRC6AQ5T6X5 926 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 FIGLAQ6QHK4 219 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 ZNF687Q8N1G0 1237 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 KDM1BQ8NB78 822 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 OR13C4Q8NGS5 318 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 OR10A6Q8NH74 314 aa4.89□□□□□ -1.63
ROS1-201ENST00000368507 PEX13Q92968 403 aa4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.4 ms