RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 SLC39A1Q9NY26 324 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 B3GNT2Q9NY97 397 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 TMOD2Q9NZR1 351 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 BCAP29Q9UHQ4 241 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 DAPK2Q9UIK4 370 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 PSME2Q9UL46 239 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 KCNJ14Q9UNX9 436 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 ACOT9Q9Y305 439 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF175Q9Y473 711 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 PHLPP1O60346 1717 aa3.3□□□□□ -1.88
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PTPRC-202ENST00000367364 RTL9Q8NET4 1388 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 PLIN4Q96Q06 1357 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 A0A1W2PPI3 338 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 HMX3A6NHT5 357 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 GOLGA8JA6NMD2 632 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 LEUTXA8MZ59 168 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 E7ESA3 106 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 F5H6K3 240 aa3.3□□□□□ -1.88
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PTPRC-202ENST00000367364 ZNF195O14628 629 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 HDAC3O15379 428 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 KLHL41O60662 606 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 UGT2B11O75310 529 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 GMNNO75496 209 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 CIAO1O76071 339 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 SNX4O95219 450 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 NADKO95544 446 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 ACSL3O95573 720 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 PTTG1O95997 202 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 NR3C1P04150 777 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 DLATP10515 647 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 KRT3P12035 628 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF30P17039 623 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 CCNA2P20248 432 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 HMGCLP35914 325 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 TRIM23P36406 574 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 GP5P40197 560 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 TSPAN7P41732 249 aa3.3□□□□□ -1.88
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PTPRC-202ENST00000367364 SLC9A3P48764 834 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 NPY2RP49146 381 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 HLCSP50747 726 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 GALCP54803 685 aa3.3□□□□□ -1.88
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PTPRC-202ENST00000367364 OLR1P78380 273 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 ENPEPQ07075 957 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 TFCP2Q12800 502 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 PMS2P3Q13401 168 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 KIR2DS3Q14952 304 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 GRAMD1BQ3KR37 738 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 IGSF11Q5DX21 431 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 PIGGQ5H8A4 983 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 C6orf52Q5T4I8 152 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 METTL11BQ5VVY1 283 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 AGAP6Q5VW22 663 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 CES4AQ5XG92 561 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 ATG16L1Q676U5 607 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 KDM4DQ6B0I6 523 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 XAF1Q6GPH4 301 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 TANGO2Q6ICL3 276 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 TATDN1Q6P1N9 297 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 CORO6Q6QEF8 472 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 MACC1Q6ZN28 852 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 HDDC2Q7Z4H3 204 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 ADIPOR2Q86V24 386 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 FAM160B2Q86V87 743 aa3.3□□□□□ -1.88
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PTPRC-202ENST00000367364 PM20D2Q8IYS1 436 aa3.3□□□□□ -1.88
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PTPRC-202ENST00000367364 ENKURQ8TC29 256 aa3.3□□□□□ -1.88
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PTPRC-202ENST00000367364 CAPSLQ8WWF8 208 aa3.3□□□□□ -1.88
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PTPRC-202ENST00000367364 APBB2Q92870 758 aa3.3□□□□□ -1.88
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PTPRC-202ENST00000367364 ZNF560Q96MR9 790 aa3.3□□□□□ -1.88
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PTPRC-202ENST00000367364 MXD3Q9BW11 206 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
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