RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 SLC35F4A4IF30 521 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 ETFAP13804 333 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF440Q8IYI8 595 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 FXYD6Q9H0Q3 95 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 IGSF5Q9NSI5 407 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 UCKL1Q9NWZ5 548 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 HSPA12AO43301 675 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 SLC19A2O60779 497 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 MT-ND2P03891 347 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 GGT1P19440 569 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 FBLP22087 321 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 HSD17B12Q53GQ0 312 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 SAMD12Q8N8I0 201 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 THAP4Q8WY91 577 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 SGTBQ96EQ0 304 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 ACSL6Q9UKU0 697 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 DISC1C4P0D8 188 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 ANHXE9PGG2 379 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 CKMT1AP12532 417 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 PGCP20142 388 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 GRHL2Q6ISB3 625 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 MYH10P35580 1976 aa19.36■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 SOBPA7XYQ1 873 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 CYP17A1P05093 508 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 PRSS56P0CW18 603 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 ADORA3P0DMS8 318 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 LAMP1P11279 417 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 PYCR1P32322 319 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF423Q2M1K9 1284 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 ALG10Q5BKT4 473 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 C1orf94Q6P1W5 598 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 KDELC1Q6UW63 502 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 FEVQ99581 238 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 TTTY10Q9BZA0 68 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM45AQ9NWC5 275 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 ERVK-18Q9QC07 812 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 PIAS3Q9Y6X2 628 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 CCNOP22674 350 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 CLRN1P58418 232 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 PIGGQ5H8A4 983 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 SPIN3Q5JUX0 258 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 ACBD7Q8N6N7 88 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 EXTL2Q9UBQ6 330 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 CLECL1Q8IZS7 167 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC20Q8TCA0 184 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 CD200R1Q8TD46 325 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 ECHDC3Q96DC8 303 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 FAM118AQ9NWS6 357 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 SH2B3Q9UQQ2 575 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 UGDHO60701 494 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 ENTPD1P49961 510 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 E2F1Q01094 437 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 GRM7Q14831 915 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 LHFPL3Q86UP9 236 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 C16orf78Q8WTQ4 265 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM19Q96HH6 336 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 LRR1Q96L50 414 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 ALG5Q9Y673 324 aa19.35■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 ADAP00813 363 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 FIGLAQ6QHK4 219 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 SCML4Q8N228 414 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 OR5L2Q8NGL0 311 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 LGALS12Q96DT0 336 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 OR1A2Q9Y585 309 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 NUAK1O60285 661 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 APOL3O95236 402 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 IL33O95760 270 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 MAGEA6P43360 314 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 PHC1P78364 1004 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 NTHL1P78549 312 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 CTC1Q2NKJ3 1217 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 OR8K3Q8NH51 312 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 MYRFLQ96LU7 910 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 MTMR10Q9NXD2 777 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 SH3PXD2BA1X283 911 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 WASH4PA8MWX3 477 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 PLD2O14939 933 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 H2BFMP0C1H6 154 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 GALNT10Q86SR1 603 aa19.34■□□□□ 0.69
CCSAP-203ENST00000366687 KCNN1Q92952 543 aa19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms