RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 COX10Q12887 443 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 ITPK1Q13572 414 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP2.17□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 EMC2Q15006 297 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC1A5Q15758 541 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 UNC50Q53HI1 259 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 C9orf66Q5T8R8 295 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 REP15Q6BDI9 236 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 EMBQ6PCB8 327 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 ASRGL1Q7L266 308 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC22A16Q86VW1 577 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRRC49Q8IUZ0 686 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 LEMD2Q8NC56 503 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP2.17□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 BEST4Q8NFU0 473 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 FBXO25Q8TCJ0 367 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 URGCPQ8TCY9 931 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPR137Q96N19 417 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPATA13Q96N96 652 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRAM1Q96QH2 718 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 HSD17B14Q9BPX1 270 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP2.17□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 ABCG8Q9H221 673 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 CARD9Q9H257 536 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 NT5DC2Q9H857 520 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 GNB4Q9HAV0 340 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 VPS54Q9P1Q0 977 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 ERVK-18Q9QC07 812 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 COPS7AQ9UBW8 275 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 MOSPD1Q9UJG1 213 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 TSPAN16Q9UKR8 245 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 FBXO7Q9Y3I1 522 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 CSAG2Q9Y5P2 127 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 STYXL1Q9Y6J8 313 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 SALL1Q9NSC2 1324 aa2.17□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 MACROD2A1Z1Q3 448 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPL37AP8A6NKH3 93 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 RNF212BA8MTL3 300 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 SH2D1BO14796 132 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 TXNL1O43396 289 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 TSPAN2O60636 221 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 SH3BGRLO75368 114 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 REC8O95072 547 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 SYNGR4O95473 234 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 HPP00738 406 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 MT-ND1P03886 318 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 FCER2P06734 321 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 FCGR3AP08637 254 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 FOSL2P15408 326 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 FCARP24071 287 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPP2R1BP30154 601 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACADSBP45954 432 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 PGFP49763 221 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 NDST1P52848 882 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 CASP9P55211 416 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 HAGHQ16775 308 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM44Q2T9K0 475 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 HIGD2BQ4VC39 106 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 EPC2Q52LR7 807 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 VWA2Q5GFL6 755 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF506Q5JVG8 444 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 LCE1FQ5T754 118 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 LIPJQ5W064 366 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 STEAP1BQ6NZ63 245 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARMCX5Q6P1M9 558 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 DLEU7Q6UYE1 221 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 RABEPKQ7Z6M1 372 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 LINC00518Q8N0U6 118 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 BATF2Q8N1L9 274 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNRF1Q8ND25 227 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM185AQ8NFB2 350 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 NEK11Q8NG66 645 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR4F5Q8NH21 305 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 EXOC6Q8TAG9 804 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 HIST1H2ACQ93077 130 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 PNPLA2Q96AD5 504 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 RUFY1Q96T51 708 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 TAS2R16Q9NYV7 291 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 NDUFA13Q9P0J0 144 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 SEC14L4Q9UDX3 406 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRIM10Q9UDY6 481 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 IL19Q9UHD0 177 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM153AQ9UHL3 310 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-78P-201ENST00000362897 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms