RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 VASH2Q86V25 355 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM126BQ8IUX1 230 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 LAX1Q8IWV1 398 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRR22Q8IZ63 422 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF525Q8N782 197 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 FBXO25Q8TCJ0 367 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 VN1R17PQ8TDU5 208 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 GUCD1Q96NT3 240 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADPGKQ9BRR6 497 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 TTYH2Q9BSA4 534 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 TEX13BQ9BXU2 312 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF350Q9GZX5 532 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZWILCHQ9H900 591 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 GRPEL1Q9HAV7 217 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 SEC14L4Q9UDX3 406 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 Q9UF83 564 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 MLXQ9UH92 298 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 KCNK6Q9Y257 313 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM129A0AVI4 362 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 MEI4A8MW99 385 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 SAP18O00422 153 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 TSC22D2O75157 780 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 STBD1O95210 358 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 CPNE6O95741 557 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 TPBGLP0DKB5 382 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF19P17023 458 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 GDF1P27539 372 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 SERPINB6P35237 376 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 MDH2P40926 338 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAGEA9P43362 315 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 TNFRSF4P43489 277 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC25A1P53007 311 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 MFAP2P55001 183 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 ASIC1P78348 528 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 GIT2Q14161 759 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPP1R3AQ16821 1122 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACER2Q5QJU3 275 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 SYCP3Q8IZU3 236 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 PARP8Q8N3A8 854 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF671Q8TAW3 534 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 HAS2Q92819 552 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAB3CQ96E17 227 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 PAXXQ9BUH6 204 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 Q9HAA7 133 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC25A19Q9HC21 320 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 ABCB8Q9NUT2 735 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLIP2Q9UDT6 1046 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 CIDEBQ9UHD4 219 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 IKZF3Q9UKT9 509 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 EXOC7Q9UPT5 735 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 SH3PXD2BA1X283 911 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC15A5A6NIM6 579 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 TNFSF11O14788 317 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRAMEF12O95522 483 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHRNGP07510 517 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 SBK2P0C263 348 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZBTB25P24278 435 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 MEOX2P50222 304 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARHGDIAP52565 204 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 SNU13P55769 128 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 CXCL6P80162 114 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 STXBP2Q15833 593 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM219BQ5XKK7 198 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 KCTD11Q693B1 232 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 CD164L2Q6UWJ8 174 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR6M1Q8NGM8 313 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 PHYHIPLQ96FC7 376 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 CXorf58Q96LI9 332 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 NTMT1Q9BV86 223 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 TIGARQ9NQ88 270 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLEC4EQ9ULY5 219 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM205AQ6ZU69 1335 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRABD2BA6NFA1 517 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM220BPB1ANY3 271 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-552P-201ENST00000362869 E7ENQ6 273 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-552P-201ENST00000362869 H0Y626 953 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-552P-201ENST00000362869 K7ERI5 159 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-552P-201ENST00000362869 TSPAN2O60636 221 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRG2P13727 222 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-552P-201ENST00000362869 PGAM2P15259 253 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-552P-201ENST00000362869 B4GALT1P15291 398 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-552P-201ENST00000362869 RGRP47804 291 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC7A2P52569 658 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC12A3P55017 1021 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-552P-201ENST00000362869 GEMP55040 296 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-552P-201ENST00000362869 PAX2Q02962 417 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC10A1Q14973 349 aa2.21□□□□□ -2.06
RNU6-552P-201ENST00000362869 STX1AQ16623 288 aa2.21□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms