RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362861.1

RNU6-1079P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1079, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1079P, Length 110 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CASP5P51878 434 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CDC16Q13042 620 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRIM29Q14134 588 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRIM14Q14142 442 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NAB2Q15742 525 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C12orf74Q32Q52 190 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MDH1BQ5I0G3 518 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SPINT4Q6UDR6 99 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ARSKQ6UWY0 536 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM122BQ7Z309 247 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TDRPQ86YL5 185 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CPOQ8IVL8 374 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 THEM5Q8N1Q8 247 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CADM2Q8N3J6 435 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PPP1R35Q8TAP8 253 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ETNPPLQ8TBG4 499 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BRSK1Q8TDC3 778 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM149B1Q96BN6 582 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HSPBAP1Q96EW2 488 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PCDHB18PQ96TA0 734 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DNAI2Q9GZS0 605 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DCLRE1BQ9H816 532 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 POLD4Q9HCU8 107 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SH2D2AQ9NP31 389 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ARFGAP3Q9NP61 516 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ALKBH4Q9NXW9 302 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PRO2289Q9P1D8 64 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DPM3Q9P2X0 92 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RPS6KA6Q9UK32 745 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MKLN1Q9UL63 735 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MYO9BQ13459 2157 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DSCAML1Q8TD84 2053 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EXPH5Q8NEV8 1989 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C19orf71A6NCJ1 209 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLC15A5A6NIM6 579 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MCF2LO15068 1137 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CCDC22O60826 627 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NPIPB7O75200 414 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KCNK5O95279 499 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HEXAP06865 529 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RRASP10301 218 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LAMP1P11279 417 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CRYGAP11844 174 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TNNT1P13805 278 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RPA2P15927 270 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PCGF2P35227 344 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF616Q08AN1 781 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GCKRQ14397 625 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BTBD16Q32M84 506 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TMEM240Q5SV17 173 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C10orf91Q5T1B1 145 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GCNT6Q5T4J0 391 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM162BQ5T6X4 162 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ATAD3BQ5T9A4 648 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FBXW9Q5XUX1 488 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF573Q86YE8 665 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C15orf56Q8N910 161 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRIML1Q8N9V2 468 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FSIP1Q8NA03 581 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR7A2PQ8NGA2 310 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR10H4Q8NGA5 316 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR52K2Q8NGK3 314 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR5M9Q8NGP3 310 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HM13Q8TCT9 377 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ACER1Q8TDN7 264 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RAB40AQ8WXH6 277 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PLAC4Q8WY50 150 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IRGQQ8WZA9 623 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HARBI1Q96MB7 349 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TMEM47Q9BQJ4 181 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SULT4A1Q9BR01 284 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CARD6Q9BX69 1037 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HRH4Q9H3N8 390 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLA2Q9H6Q3 261 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FANCLQ9NW38 375 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLC5A4Q9NY91 659 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CD207Q9UJ71 328 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 STUB1Q9UNE7 303 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GDAQ9Y2T3 454 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1079P-201ENST00000362861 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP-1.92□□□□□ -2.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms