RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356384.4

RXRA-201, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RXRA, Length 5,770 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-201ENST00000356384 LY6G5CQ5SRR4 150 aa15.39■□□□□ 0.06
RXRA-201ENST00000356384 TIFABQ6ZNK6 161 aa15.39■□□□□ 0.06
RXRA-201ENST00000356384 KLBQ86Z14 1044 aa15.39■□□□□ 0.06
RXRA-201ENST00000356384 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.06
RXRA-201ENST00000356384 DOHHQ9BU89 302 aa15.39■□□□□ 0.06
RXRA-201ENST00000356384 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa15.39■□□□□ 0.06
RXRA-201ENST00000356384 FMO6PO60774 539 aa15.39■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 ADH1BP00325 375 aa15.39■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 MAS1P04201 325 aa15.39■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 ADH6P28332 368 aa15.39■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 CLCA4Q14CN2 919 aa15.39■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 CTC1Q2NKJ3 1217 aa15.39■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 FAM205BPQ63HN1 556 aa15.39■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 CFAP77Q6ZQR2 320 aa15.39■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 UBQLNLQ8IYU4 475 aa15.39■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 MTG2Q9H4K7 406 aa15.39■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 PSAT1Q9Y617 370 aa15.39■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 C12orf71A8MTZ7 269 aa15.39■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 CA12O43570 354 aa15.39■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 TMBIM6P55061 237 aa15.39■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 DNAJB13P59910 316 aa15.39■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 DHCR24Q15392 516 aa15.39■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 WDR45BQ5MNZ6 344 aa15.39■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 ASPGQ86U10 573 aa15.39■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 GLYATL2Q8WU03 294 aa15.39■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 BCO2Q9BYV7 579 aa15.39■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 GCGRP47871 477 aa15.39■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 RAB5BP61020 215 aa15.39■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 METTL25Q8N6Q8 603 aa15.39■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 DOK4Q8TEW6 326 aa15.39■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 SGIP1Q9BQI5 828 aa15.39■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 MINDY3Q9H8M7 445 aa15.39■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 PLEKHA3Q9HB20 300 aa15.39■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 CD9P21926 228 aa15.39■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 ZNF181Q2M3W8 571 aa15.39■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 FAM214AQ32MH5 1076 aa15.39■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa15.39■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 HS3ST5Q8IZT8 346 aa15.39■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 RHBDF1Q96CC6 855 aa15.39■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 ACSL6Q9UKU0 697 aa15.39■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 A0A096LPI6 279 aa15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 ETV3P41162 512 aa15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 TRAM1L1Q8N609 369 aa15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 DEFB126Q9BYW3 111 aa15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 RXFP3Q9NSD7 469 aa15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 KIAA0513O60268 411 aa15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 OR2B3O76000 313 aa15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 CRISP1P54107 249 aa15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 LIPJQ5W064 366 aa15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 CNKSR3Q6P9H4 555 aa15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 TMEM107Q6UX40 140 aa15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 TRIM46Q7Z4K8 759 aa15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 OR8J3Q8NGG0 315 aa15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 INSL5Q9Y5Q6 135 aa15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 A0A0U1RQF3 1178 aa15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 PMM2O15305 246 aa15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 SLAMF1Q13291 335 aa15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 ATG9BQ674R7 924 aa15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 ZNF100Q8IYN0 542 aa15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 TRIB2Q92519 343 aa15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 DNTTIP1Q9H147 329 aa15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 ACSL5Q9ULC5 683 aa15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 H0YAE9 185 aa15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 CPNE6O95741 557 aa15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 PPA1Q15181 289 aa15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 RAET1LQ5VY80 246 aa15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 ZFP41Q8N8Y5 198 aa15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 RDH12Q96NR8 316 aa15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 ZNF382Q96SR6 550 aa15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 SMOQ99835 787 aa15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 HMX3A6NHT5 357 aa15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 TSPAN6O43657 245 aa15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 CAMLGP49069 296 aa15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 ARHGAP1Q07960 439 aa15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 KANK2Q63ZY3 851 aa15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 IFNL1Q8IU54 200 aa15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 ABCG5Q9H222 651 aa15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 TLR9Q9NR96 1032 aa15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 RBPJLQ9UBG7 517 aa15.38■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 SH3PXD2BA1X283 911 aa15.37■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 OR6C74A6NCV1 312 aa15.37■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 SCGB2A1O75556 95 aa15.37■□□□□ 0.05
RXRA-201ENST00000356384 PIGRP01833 764 aa15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms