RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 NT5EP21589 574 aa25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 C6orf163Q5TEZ5 329 aa25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 SUN3Q8TAQ9 357 aa25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANKRD27Q96NW4 1050 aa25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 DGAT2Q96PD7 388 aa25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 PHF12Q96QT6 1004 aa25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 THTPAQ9BU02 230 aa25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 CROCCQ5TZA2 2017 aa25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 EVPLLA8MZ36 301 aa25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 IFNA16P05015 189 aa25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 HEXBP07686 556 aa25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 UQCRC2P22695 453 aa25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPIBP23284 216 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 PGM1P36871 562 aa25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 DUSP2Q05923 314 aa25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 GTDC1Q4AE62 458 aa25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 NANOGP8Q6NSW7 305 aa25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 MARCH9Q86YJ5 346 aa25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR9A2Q8NGT5 310 aa25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDRT15Q96T59 188 aa25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC35A5Q9BS91 424 aa25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC26A1Q9H2B4 701 aa25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 NANOGQ9H9S0 305 aa25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC6A13Q9NSD5 602 aa25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa25.73■■□□□ 1.71
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa25.72■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa25.72■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR2W5A6NFC9 320 aa25.72■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 GSC2O15499 205 aa25.72■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP1B1P05026 303 aa25.72■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD63P08962 238 aa25.72■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 PTPN6P29350 595 aa25.72■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDK9P50750 372 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC7A2P52569 658 aa25.72■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 NKG7Q16617 165 aa25.72■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 RUNDC3AQ59EK9 446 aa25.72■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 LCN10Q6JVE6 187 aa25.72■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR8J3Q8NGG0 315 aa25.72■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 VN1R1Q9GZP7 353 aa25.72■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 CXorf36Q9H7Y0 433 aa25.72■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 C3orf14Q9HBI5 128 aa25.72■■□□□ 1.71
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CTDNEP1-201ENST00000318988 FOXJ2Q9P0K8 574 aa25.72■■□□□ 1.71
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CTDNEP1-201ENST00000318988 DLGAP3O95886 979 aa25.71■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC6A2P23975 617 aa25.71■■□□□ 1.71
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa25.71■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa25.71■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 SZRD1Q7Z422 152 aa25.71■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 PSMA8Q8TAA3 256 aa25.71■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 WDR54Q9H977 334 aa25.71■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 CORO2BQ9UQ03 480 aa25.71■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 ERVK-11Q9UQG0 969 aa25.71■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 AP3M1Q9Y2T2 418 aa25.71■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa25.7■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa25.7■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 VSTM2BA6NLU5 285 aa25.7■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLITRK5O94991 958 aa25.7■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 KRT75O95678 551 aa25.7■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 STT3AP46977 705 aa25.7■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCT3P49368 545 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 GAB1Q13480 694 aa25.7■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 BHLHB9Q6PI77 547 aa25.7■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM107Q6UX40 140 aa25.7■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 LAPTM4BQ86VI4 370 aa25.7■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 MSRB3Q8IXL7 192 aa25.7■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 ESX1Q8N693 406 aa25.7■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADCY4Q8NFM4 1077 aa25.7■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR5AK3PQ8NH89 298 aa25.7■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 MOAP1Q96BY2 351 aa25.7■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAGED4Q96JG8 741 aa25.7■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 TPT1P8Q9HAU6 139 aa25.7■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 TNNI3P19429 210 aa25.69■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 PTGER1P34995 402 aa25.69■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 MTPNP58546 118 aa25.69■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRR5P85299 388 aa25.69■■□□□ 1.7
CTDNEP1-201ENST00000318988 LTB4RQ15722 352 aa25.69■■□□□ 1.7
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