RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284273.5

UBASH3B-201, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBASH3B, Length 6,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM117AQ9C073 453 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 MS4A12Q9NXJ0 267 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 S1PR1P21453 382 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF423Q2M1K9 1284 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 CARM1Q86X55 608 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 CROCCP3Q8IVE0 287 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 RETREG1Q9H6L5 497 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 HIF1ANQ9NWT6 349 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 OR14J1Q9UGF5 321 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 RPH3ALQ9UNE2 315 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 HMGN1P05114 100 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 CTHP32929 405 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 PIGFQ07326 219 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 OR7A5Q15622 319 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC30A8Q8IWU4 369 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 CCDC36Q8IYA8 594 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 FOLH1BQ9HBA9 442 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF446Q9NWS9 450 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 C17orf105B2RV13 164 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 RDH16O75452 317 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 HTR3BO95264 441 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 CD3GP09693 182 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 RNH1P13489 461 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 PTGIRP43119 386 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 CD97P48960 835 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 TCEAL8Q8IYN2 117 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 PYURFQ96I23 114 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 LMF1Q96S06 567 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 LRIT1Q9P2V4 623 aa11.35□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 GSTM4Q03013 218 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF763Q0D2J5 394 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 CLLU1OSQ5K130 101 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 OR4D6Q8NGJ1 314 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 SCGB1C1Q8TD33 95 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 C12orf42Q96LP6 360 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 TSGA13Q96PP4 275 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 LRRC3Q9BY71 257 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 TRIM36Q9NQ86 728 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 DNAJB9Q9UBS3 223 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 CBFA2T3O75081 653 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 OR1D4P47884 311 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 LSSP48449 732 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 LINC00471Q8N535 108 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 CHFRQ96EP1 664 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 UBR1Q8IWV7 1749 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 LRRC10BA6NIK2 292 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC1A7O00341 560 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 DLX3O60479 287 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 CER1O95813 267 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF43P17038 809 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 TNFRSF8P28908 595 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC15A1P46059 708 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 ADAM17P78536 824 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 FXNQ16595 210 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF585AQ6P3V2 769 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 KBTBD6Q86V97 674 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 HORMAD2Q8N7B1 307 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 C10orf82Q8WW14 230 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 LRCH3Q96II8 777 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 REEP4Q9H6H4 257 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 ALG5Q9Y673 324 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 LTN1O94822 1766 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 AP1G1O43747 822 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 AMY2BP19961 511 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 CAV3P56539 151 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 WDR5P61964 334 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 ZP2Q05996 745 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 SCAPQ12770 1279 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 WSCD2Q2TBF2 565 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 MSS51Q4VC12 460 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 USP43Q70EL4 1123 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 TRAM1L1Q8N609 369 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 FGF13Q92913 245 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 ROPN1LQ96C74 230 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 GKN3PP0CG01 181 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 RAC2P15153 192 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 ABRAXAS2Q15018 415 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 LRIF1Q5T3J3 769 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 LHFPL3Q86UP9 236 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 ANKK1Q8NFD2 765 aa11.34□□□□□ -0.59
UBASH3B-201ENST00000284273 OR52P1PQ8NH57 321 aa11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms