RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281043.3

MYCN-201, Transcript of MYCN proto-oncogene, bHLH transcription factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene MYCN, Length 2,602 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCN-201ENST00000281043 CHST9Q7L1S5 443 aa20.37■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 UCN3Q969E3 161 aa20.37■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 SORCS2Q96PQ0 1159 aa20.37■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 C1GALT1Q9NS00 363 aa20.37■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 ACSL6Q9UKU0 697 aa20.37■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 CCDC88CQ9P219 2028 aa20.37■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 NINQ8N4C6 2090 aa20.37■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa20.37■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa20.37■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 GJB5O95377 273 aa20.37■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 ADAP00813 363 aa20.37■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 IFNW1P05000 195 aa20.37■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 GLULP15104 373 aa20.37■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 GSTM5P46439 218 aa20.37■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 ZNF385BQ569K4 471 aa20.37■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 GARNL3Q5VVW2 1013 aa20.37■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 VRK3Q8IV63 474 aa20.37■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 TM9SF4Q92544 642 aa20.37■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 PKP4Q99569 1192 aa20.37■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 GPR62Q9BZJ7 368 aa20.37■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 TMEM38AQ9H6F2 299 aa20.37■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 NDOR1Q9UHB4 597 aa20.37■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa20.37■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 THSD7BQ9C0I4 1608 aa20.37■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 IFNA7P01567 189 aa20.36■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 IRS1P35568 1242 aa20.36■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 FGFBP1Q14512 234 aa20.36■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 SNAPC1Q16533 368 aa20.36■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 GPAT4Q86UL3 456 aa20.36■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 PLA2G15Q8NCC3 412 aa20.36■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 GPR156Q8NFN8 814 aa20.36■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa20.36■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa20.36■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 SRRDQ9UH36 339 aa20.36■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 SLC30A4O14863 429 aa20.36■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 C6orf47O95873 294 aa20.36■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 HOXD10P28358 340 aa20.36■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 ZNF33BQ06732 778 aa20.36■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 ARSKQ6UWY0 536 aa20.36■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 TRILQ7L0X0 811 aa20.36■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 OR11H4Q8NGC9 324 aa20.36■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 OR8J1Q8NGP2 316 aa20.36■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 EMC7Q9NPA0 242 aa20.36■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 KLHL42Q9P2K6 505 aa20.36■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 ZNF222Q9UK12 451 aa20.36■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa20.36■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 SCN8AQ9UQD0 1980 aa20.35■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 A0A1W2PQY0 241 aa20.35■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 HEPACAM2A8MVW5 462 aa20.35■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 STK25O00506 426 aa20.35■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 CASKO14936 926 aa20.35■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 ALDH1A1P00352 501 aa20.35■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 RRASP10301 218 aa20.35■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 CCT3P49368 545 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 CLCNKAP51800 687 aa20.35■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 XKP51811 444 aa20.35■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 BAMBIQ13145 260 aa20.35■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 RPA4Q13156 261 aa20.35■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 LRRC32Q14392 662 aa20.35■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 HEPACAMQ14CZ8 416 aa20.35■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 C12orf73Q69YU5 71 aa20.35■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 ADNP2Q6IQ32 1131 aa20.35■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 ADGRG3Q86Y34 549 aa20.35■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa20.35■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 IL17RCQ8NAC3 791 aa20.35■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa20.35■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa20.35■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 HCN2Q9UL51 889 aa20.35■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 FFAR1O14842 300 aa20.35■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 ETV5P41161 510 aa20.35■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 ETV1P50549 477 aa20.35■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 B4GALNT1Q00973 533 aa20.35■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 DOC2AQ14183 400 aa20.35■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 CDKN3Q16667 212 aa20.35■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 TRIM40Q6P9F5 258 aa20.35■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 CEACAM20Q6UY09 585 aa20.35■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 QSOX2Q6ZRP7 698 aa20.35■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 OXR1Q8N573 874 aa20.35■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 GPR26Q8NDV2 337 aa20.35■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 OR5AK3PQ8NH89 298 aa20.35■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 MTMR11A4FU01 709 aa20.34■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 E7EQ34 232 aa20.34■□□□□ 0.85
MYCN-201ENST00000281043 K7ERQ8 282 aa20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms