RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267328.4

RAB20-201, Transcript of RAB20, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB20, Length 1,518 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20-201ENST00000267328 PCOLCEQ15113 449 aa22.11■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 SPANXN4Q5MJ08 99 aa22.11■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 BROXQ5VW32 411 aa22.11■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 DUSP26Q9BV47 211 aa22.11■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 NMUR2Q9GZQ4 415 aa22.11■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 SLAMF7Q9NQ25 335 aa22.11■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa22.1■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa22.1■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 CDC14CA4D256 554 aa22.1■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 OR10H2O60403 315 aa22.1■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 MPIP34949 423 aa22.1■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 KIR3DL1P43629 444 aa22.1■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 CDC20Q12834 499 aa22.1■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 TERF2Q15554 542 aa22.1■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa22.1■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 FUNDC1Q8IVP5 155 aa22.1■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 CCDC116Q8IYX3 515 aa22.1■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 THAP4Q8WY91 577 aa22.1■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 LPAR4Q99677 370 aa22.1■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 GLIPR2Q9H4G4 154 aa22.1■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 P4HTMQ9NXG6 502 aa22.1■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 FAM234BA2RU67 622 aa22.09■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 SAGE2PA6NJ88 616 aa22.09■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 C9JVG2 144 aa22.09■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 CCDC22O60826 627 aa22.09■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 WNT3P56703 355 aa22.09■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 ATP1A4Q13733 1029 aa22.09■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 MLC1Q15049 377 aa22.09■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 SPRED3Q2MJR0 410 aa22.09■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 PGS1Q32NB8 556 aa22.09■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa22.09■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 CCDC81Q6ZN84 652 aa22.09■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa22.09■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 NDUFAF7Q7L592 441 aa22.09■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa22.09■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 OR14A16Q8NHC5 309 aa22.09■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 AMDHD1Q96NU7 426 aa22.09■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 CCDC167Q9P0B6 97 aa22.09■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 LAMA5O15230 3695 aa22.09■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 A8MUA0 341 aa22.08■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 PEX12O00623 359 aa22.08■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 IL6P05231 212 aa22.08■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 PGRP06401 933 aa22.08■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 S100A3P33764 101 aa22.08■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 UCNP55089 124 aa22.08■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 PHC1P78364 1004 aa22.08■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 RCAN2Q14206 197 aa22.08■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 OR4F3Q6IEY1 312 aa22.08■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 ANKS4BQ8N8V4 417 aa22.08■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 BCAS4Q8TDM0 211 aa22.08■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 TUBB6Q9BUF5 446 aa22.08■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 CXorf21Q9HAI6 301 aa22.08■■□□□ 1.13
RAB20-201ENST00000267328 C17orf105B2RV13 164 aa22.07■■□□□ 1.12
RAB20-201ENST00000267328 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
RAB20-201ENST00000267328 SCN2BO60939 215 aa22.07■■□□□ 1.12
RAB20-201ENST00000267328 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
RAB20-201ENST00000267328 HPP00738 406 aa22.07■■□□□ 1.12
RAB20-201ENST00000267328 PRKAR1AP10644 381 aa22.07■■□□□ 1.12
RAB20-201ENST00000267328 NT5EP21589 574 aa22.07■■□□□ 1.12
RAB20-201ENST00000267328 ITPKBP27987 946 aa22.07■■□□□ 1.12
RAB20-201ENST00000267328 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
RAB20-201ENST00000267328 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa22.07■■□□□ 1.12
RAB20-201ENST00000267328 AGKQ53H12 422 aa22.07■■□□□ 1.12
RAB20-201ENST00000267328 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa22.07■■□□□ 1.12
RAB20-201ENST00000267328 ZFP28Q8NHY6 868 aa22.07■■□□□ 1.12
RAB20-201ENST00000267328 ZNF675Q8TD23 568 aa22.07■■□□□ 1.12
RAB20-201ENST00000267328 RIT1Q92963 219 aa22.07■■□□□ 1.12
RAB20-201ENST00000267328 IMMP1LQ96LU5 166 aa22.07■■□□□ 1.12
RAB20-201ENST00000267328 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
RAB20-201ENST00000267328 FBXL4Q9UKA2 621 aa22.07■■□□□ 1.12
RAB20-201ENST00000267328 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
RAB20-201ENST00000267328 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa22.07■■□□□ 1.12
RAB20-201ENST00000267328 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa22.06■■□□□ 1.12
RAB20-201ENST00000267328 K7ENP7 123 aa22.06■■□□□ 1.12
RAB20-201ENST00000267328 FCHO1O14526 889 aa22.06■■□□□ 1.12
RAB20-201ENST00000267328 NDUFAB1O14561 156 aa22.06■■□□□ 1.12
RAB20-201ENST00000267328 SLC22A2O15244 555 aa22.06■■□□□ 1.12
RAB20-201ENST00000267328 TNNI3P19429 210 aa22.06■■□□□ 1.12
RAB20-201ENST00000267328 DGKQP52824 942 aa22.06■■□□□ 1.12
RAB20-201ENST00000267328 ZNF628Q5EBL2 1059 aa22.06■■□□□ 1.12
RAB20-201ENST00000267328 ANXA8L1Q5VT79 327 aa22.06■■□□□ 1.12
RAB20-201ENST00000267328 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
RAB20-201ENST00000267328 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
RAB20-201ENST00000267328 GALNT12Q8IXK2 581 aa22.06■■□□□ 1.12
RAB20-201ENST00000267328 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
RAB20-201ENST00000267328 OR9A2Q8NGT5 310 aa22.06■■□□□ 1.12
RAB20-201ENST00000267328 CTHRC1Q96CG8 243 aa22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms