RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000223208.9

CEP41-201, Transcript of centrosomal protein 41, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CEP41, Length 6,513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP41-201ENST00000223208 CLEC17AQ6ZS10 378 aa11.13□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa11.13□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 NPAS3Q8IXF0 933 aa11.13□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 IL1F10Q8WWZ1 152 aa11.13□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 SSX3Q99909 188 aa11.13□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 TMEM109Q9BVC6 243 aa11.13□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 SMOC2Q9H3U7 446 aa11.13□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 H0YJX3 145 aa11.13□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 DBHP09172 617 aa11.13□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 GTF2F2P13984 249 aa11.13□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 DEFB103AP81534 67 aa11.13□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 OR52A4PA6NMU1 304 aa11.13□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 GLSO94925 669 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 CHRM4P08173 479 aa11.13□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 LSSP48449 732 aa11.13□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 SPANXN4Q5MJ08 99 aa11.13□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 ZNF585AQ6P3V2 769 aa11.13□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa11.13□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 SLC5A8Q8N695 610 aa11.13□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 KCNN1Q92952 543 aa11.13□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 MUCL1Q96DR8 90 aa11.13□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 EBF4Q9BQW3 602 aa11.13□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 HES7Q9BYE0 225 aa11.13□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 TPT1P8Q9HAU6 139 aa11.13□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 TVP23AA6NH52 213 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 EI24O14681 340 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 ENTPD6O75354 484 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 PTPN6P29350 595 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 TYSND1Q2T9J0 566 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 FOXQ1Q9C009 403 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 MLXQ9UH92 298 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 MKLN1Q9UL63 735 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 H7C417 338 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 HSPB6O14558 160 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 WDPCPO95876 746 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 CBSLP0DN79 551 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 PNMTP11086 282 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 BMP4P12644 408 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 CHRNB2P17787 502 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 NDUFV2P19404 249 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 CBSP35520 551 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 SEC23BQ15437 767 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 RTP2Q5QGT7 225 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 NDNFQ8TB73 568 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 COG8Q96MW5 612 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 HIPK2Q9H2X6 1198 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 KAT6AQ92794 2004 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 SLIT1O75093 1534 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 A8MT66 165 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 IMPDH1P20839 514 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 C5AR1P21730 350 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 CD70P32970 193 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 SLX4IPQ5VYV7 408 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 ZBTB26Q9HCK0 441 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 C2orf42Q9NWW7 574 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 IGSF9Q9P2J2 1179 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 ZNF180Q9UJW8 692 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 RAB27BO00194 218 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 NPHS1O60500 1241 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 ANXA3P12429 323 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 PRKXP51817 358 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 TLE3Q04726 772 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 NTRK2Q16620 822 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 C6orf183Q5T699 404 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 NKAIN2Q5VXU1 208 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 TSGA13Q96PP4 275 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 BCORL1Q5H9F3 1711 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 CD97P48960 835 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 RGS6P49758 472 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 DOC2AQ14183 400 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 EMC10Q5UCC4 262 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 SPAG16Q8N0X2 631 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 LRRC18Q8N456 261 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 CHST14Q8NCH0 376 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 SUCNR1Q9BXA5 334 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 CD244Q9BZW8 370 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 ACTL7AQ9Y615 435 aa11.12□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 I3L1I5 382 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 CKMT1AP12532 417 aa11.11□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 TCN2P20062 427 aa11.11□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 PEX2P28328 305 aa11.11□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 LEG1Q6P5S2 330 aa11.11□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 C6orf120Q7Z4R8 191 aa11.11□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa11.11□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa11.11□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 NUDT22Q9BRQ3 303 aa11.11□□□□□ -0.63
CEP41-201ENST00000223208 ABRACLQ9P1F3 81 aa11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms