RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635397.1

SMARCA2-241, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2, humanhuman

TSL 4

Gene SMARCA2, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2-241ENST00000635397 IFNAR2P48551 515 aa4.58□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 SSTP61278 116 aa4.58□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 RBBP4Q09028 425 aa4.58□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 KRT81Q14533 505 aa4.58□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa4.58□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 RTL6Q6ICC9 239 aa4.58□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 LCLAT1Q6UWP7 414 aa4.58□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 ZNF730Q6ZMV8 503 aa4.58□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 OR10G7Q8NGN6 311 aa4.58□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 LIPHQ8WWY8 451 aa4.58□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 RAB39BQ96DA2 213 aa4.58□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 DTNBP1Q96EV8 351 aa4.58□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 PINK1Q9BXM7 581 aa4.58□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 CCSER1Q9C0I3 900 aa4.58□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 SLC26A1Q9H2B4 701 aa4.58□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 ECT2Q9H8V3 914 aa4.58□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 GDF3Q9NR23 364 aa4.58□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 DCAF16Q9NXF7 216 aa4.58□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 SH3PXD2BA1X283 911 aa4.57□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 YJEFN3A6XGL0 299 aa4.57□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 K7EQD1 137 aa4.57□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 MCF2LO15068 1137 aa4.57□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 CLDN3O15551 220 aa4.57□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 TNFSF12O43508 249 aa4.57□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 KIAA0513O60268 411 aa4.57□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 NME2P1O60361 137 aa4.57□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 CSO75390 466 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 OR6A2O95222 327 aa4.57□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 FCARP24071 287 aa4.57□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 HNMTP50135 292 aa4.57□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 ERVK-16P61578 105 aa4.57□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 ELP6Q0PNE2 266 aa4.57□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 SPP2Q13103 211 aa4.57□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 GPAT3Q53EU6 434 aa4.57□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 CMPK2Q5EBM0 449 aa4.57□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 WDR49Q8IV35 697 aa4.57□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 OR4N5Q8IXE1 308 aa4.57□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 ZNF614Q8N883 585 aa4.57□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 GOLGA5Q8TBA6 731 aa4.57□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 TCP11Q8WWU5 503 aa4.57□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 RAB7BQ96AH8 199 aa4.57□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 NSMCE3Q96MG7 304 aa4.57□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 RAB40CQ96S21 281 aa4.57□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 COQ7Q99807 217 aa4.57□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 RIBC2Q9H4K1 309 aa4.57□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 HOMER3Q9NSC5 361 aa4.57□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 BARHL2Q9NY43 387 aa4.57□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 TMOD2Q9NZR1 351 aa4.57□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 VPS54Q9P1Q0 977 aa4.57□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 PLA2G4CQ9UP65 541 aa4.57□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa4.56□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 LOC105371242A0A075B767 164 aa4.56□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 A0A0U1RRA0 63 aa4.56□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 A0A1B0GWJ7 208 aa4.56□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 OR5H15A6NDH6 313 aa4.56□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 G3V2L1 256 aa4.56□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 ZG16O60844 167 aa4.56□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 LRP3O75074 770 aa4.56□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 SCGB2A1O75556 95 aa4.56□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 ANXA9O76027 345 aa4.56□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 SYNGR4O95473 234 aa4.56□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 KRT6BP04259 564 aa4.56□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa4.56□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 RPS2P15880 293 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 FUT1P19526 365 aa4.56□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 PKLRP30613 574 aa4.56□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 KRT6CP48668 564 aa4.56□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 NDST2P52849 883 aa4.56□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 LIMK2P53671 638 aa4.56□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 ATP12AP54707 1039 aa4.56□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 PMP22Q01453 160 aa4.56□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 LRRC74AQ0VAA2 488 aa4.56□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 PDZK1IP1Q13113 114 aa4.56□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa4.56□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 C3P1Q6ZMU1 363 aa4.56□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 RGS9BPQ6ZS82 235 aa4.56□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 AMZ2Q86W34 360 aa4.56□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 PARP8Q8N3A8 854 aa4.56□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 OR52B6Q8NGF0 335 aa4.56□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 OR56B1Q8NGI3 324 aa4.56□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa4.56□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 CARD6Q9BX69 1037 aa4.56□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 SIRPDQ9H106 197 aa4.56□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 PLEKHA3Q9HB20 300 aa4.56□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 CENPMQ9NSP4 180 aa4.56□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 TXLNGQ9NUQ3 528 aa4.56□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 ERVK-18Q9QC07 812 aa4.56□□□□□ -1.68
SMARCA2-241ENST00000635397 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms