RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625905.1

NELFE-214, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NELFE, Length 111 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-214ENST00000625905 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 CNPPD1Q9BV87 410 aa8.6□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 DEFB126Q9BYW3 111 aa8.6□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 TRIM4Q9C037 500 aa8.6□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa8.6□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 TRAF6Q9Y4K3 522 aa8.6□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa8.6□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa8.6□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 ZNF462Q96JM2 2506 aa8.6□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 TRAV17A0A0B4J275 112 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 OR5H15A6NDH6 313 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 GABRR3A8MPY1 467 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 FCHO1O14526 889 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 PIP5K1BO14986 540 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 PGRMC2O15173 223 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 MAN1A2O60476 641 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 DDAH2O95865 285 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 WDPCPO95876 746 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 IL3P08700 152 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 LINC00032P0C843 101 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 SLC35E2P0CK97 266 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 BGNP21810 368 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 GRK2P25098 689 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 ARRB2P32121 409 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 RPL38P63173 70 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 RAE1P78406 368 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 MPP2Q14168 576 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 SPRED3Q2MJR0 410 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 AGBL2Q5U5Z8 902 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 H3F3CQ6NXT2 135 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 SLC48A1Q6P1K1 146 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 HSDL2Q6YN16 418 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 CLYBLQ8N0X4 340 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 Q8NA96 180 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 OR4K14Q8NGD5 310 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 OR1N1Q8NGS0 311 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 OR6Y1Q8NGX8 325 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 SUN3Q8TAQ9 357 aa8.59□□□□□ -1.03
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NELFE-214ENST00000625905 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 RIT1Q92963 219 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 UCN3Q969E3 161 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 TM4SF18Q96CE8 201 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 FBXL20Q96IG2 436 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 NPAS2Q99743 824 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 TUBB1Q9H4B7 451 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 LRTM1Q9HBL6 345 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 PFDN4Q9NQP4 134 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 GIMAP4Q9NUV9 329 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 C1orf109Q9NX04 203 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 SIRT5Q9NXA8 310 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 PLA2G3Q9NZ20 509 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 STMN3Q9NZ72 180 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 MAP10Q9P2G4 905 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 UTS2RQ9UKP6 389 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 ENTPD4Q9Y227 616 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa8.59□□□□□ -1.03
NELFE-214ENST00000625905 KALRNO60229 2985 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-214ENST00000625905 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-214ENST00000625905 CFAP46Q8IYW2 2715 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-214ENST00000625905 A0A1W2PS29 197 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-214ENST00000625905 WASHC1A8K0Z3 465 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-214ENST00000625905 NPIPB8E9PQR5 432 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-214ENST00000625905 SEC22BO75396 215 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-214ENST00000625905 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
NELFE-214ENST00000625905 ZFAND5O76080 213 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-214ENST00000625905 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
NELFE-214ENST00000625905 FGF4P08620 206 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-214ENST00000625905 CPMP14384 443 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-214ENST00000625905 DRD2P14416 443 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-214ENST00000625905 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
NELFE-214ENST00000625905 NT5EP21589 574 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-214ENST00000625905 PRPH2P23942 346 aa8.58□□□□□ -1.04
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NELFE-214ENST00000625905 GPR143P51810 404 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-214ENST00000625905 XKP51811 444 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-214ENST00000625905 SLC18A1P54219 525 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-214ENST00000625905 MLLT10P55197 1068 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-214ENST00000625905 MLF1P58340 268 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-214ENST00000625905 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
NELFE-214ENST00000625905 ERVK-8P63133 956 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-214ENST00000625905 TUBA3CQ13748 450 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-214ENST00000625905 HEPACAMQ14CZ8 416 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-214ENST00000625905 INAQ16352 499 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-214ENST00000625905 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
NELFE-214ENST00000625905 GALNTL6Q49A17 601 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-214ENST00000625905 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
NELFE-214ENST00000625905 NOXRED1Q6NXP6 359 aa8.58□□□□□ -1.04
NELFE-214ENST00000625905 TUBA3EQ6PEY2 450 aa8.58□□□□□ -1.04
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