RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 IST1P53990 364 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRF-216ENST00000617451 FOLH1Q04609 750 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRF-216ENST00000617451 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRF-216ENST00000617451 ARSKQ6UWY0 536 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRF-216ENST00000617451 GPR180Q86V85 440 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRF-216ENST00000617451 ART5Q96L15 291 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRF-216ENST00000617451 PROK2Q9HC23 129 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRF-216ENST00000617451 NUDT4Q9NZJ9 180 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRF-216ENST00000617451 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PTPRF-216ENST00000617451 K7EPI3 171 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.261e-7■□□□□ 10
PTPRF-216ENST00000617451 CTAG2O75638 210 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 PAFAH1B1P43034 410 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 GNG11P61952 73 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 KCNJ2P63252 427 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 PLIN5Q00G26 463 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 FBXW8Q8N3Y1 598 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 RNF175Q8N4F7 328 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 UBTD2Q8WUN7 234 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 RGMAQ96B86 450 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 ATOH8Q96SQ7 321 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 ACKR4Q9NPB9 350 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.264e-7■□□□□ 9.9
PTPRF-216ENST00000617451 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 CNIH4Q9P003 139 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 OPTCQ9UBM4 332 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 ADGRE2Q9UHX3 823 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 LRRC3CA6NJW4 275 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 FBXO45P0C2W1 286 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 SPRP35270 261 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 TNFRSF17Q02223 184 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 DLG1Q12959 904 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 PRAMEF20Q5VT98 475 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 C18orf63Q68DL7 685 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 GRHL2Q6ISB3 625 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 OR10G3Q8NGC4 313 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 HUS1BQ8NHY5 278 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 QPCTLQ9NXS2 382 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 WHRNQ9P202 907 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 B4GALT7Q9UBV7 327 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 PHF11Q9UIL8 331 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 SUPT3HB4E1H0 165 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 UBXN8O00124 270 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 PLPP1O14494 284 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 KERAO60938 352 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 SUPT3HO75486 399 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 SLC35E2BP0CK96 405 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 PIK3CBP42338 1070 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 RAP1GDS1P52306 607 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 GRTP1Q5TC63 336 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 FAM13CQ8NE31 585 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 DOK4Q8TEW6 326 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 NINJ1Q92982 152 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 TMUB1Q9BVT8 246 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 CXXC4Q9H2H0 198 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 NMRAL1Q9HBL8 299 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 DMRT3Q9NQL9 472 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 RNF14Q9UBS8 474 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 ABCA4P78363 2273 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 PROM1O43490 865 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 EPB42P16452 691 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 SERPINB3P29508 390 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 GPX6P59796 221 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 HERVK_113P63132 956 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 ERVK-8P63133 956 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 CALCOCO2Q13137 446 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 SPRED3Q2MJR0 410 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 SEM1Q6ZVN7 128 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 RAPH1Q70E73 1250 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 SLC29A4Q7RTT9 530 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 CMC1Q7Z7K0 106 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 CTAGE3PQ8IX95 158 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 ZZZ3Q8IYH5 903 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 ULK2Q8IYT8 1036 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 NEIL3Q8TAT5 605 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 GAL3ST4Q96RP7 486 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 FOXC2Q99958 501 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 CENPKQ9BS16 269 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 ERP44Q9BS26 406 aa22.92■■□□□ 1.26
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