RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597315.5

BRD4-208, Transcript of bromodomain containing 4, humanhuman

TSL 5

Gene BRD4, Length 892 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4-208ENST00000597315 NEURL1O76050 574 aa25.05■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 DDAH2O95865 285 aa25.05■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 TUBBP07437 444 aa25.05■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 ESPL1Q14674 2120 aa25.05■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 LIPMQ5VYY2 423 aa25.05■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa25.05■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa25.05■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 OR4K14Q8NGD5 310 aa25.05■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 OR8K3Q8NH51 312 aa25.05■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 AGAP11Q8TF27 550 aa25.05■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 ASB15Q8WXK1 588 aa25.05■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 RIT1Q92963 219 aa25.05■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 SCMH1Q96GD3 660 aa25.05■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 SMC6Q96SB8 1091 aa25.05■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 CNPPD1Q9BV87 410 aa25.05■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 FAIM2Q9BWQ8 316 aa25.05■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 HES7Q9BYE0 225 aa25.05■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 MYOTQ9UBF9 498 aa25.05■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 LGALS13Q9UHV8 139 aa25.05■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 TIMM22Q9Y584 194 aa25.05■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 C1orf226A1L170 272 aa25.04■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 A8MVJ9 347 aa25.04■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 RNF4P78317 190 aa25.04■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 IMPG1Q17R60 797 aa25.04■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 FRMD7Q6ZUT3 714 aa25.04■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 TRABD2AQ86V40 505 aa25.04■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 SLX1AQ9BQ83 275 aa25.04■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 HPF1Q9NWY4 346 aa25.04■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 PSME2Q9UL46 239 aa25.04■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 WWP2O00308 870 aa25.03■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 PGRMC2O15173 223 aa25.03■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 OR2J2O76002 312 aa25.03■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 SLC35E2P0CK97 266 aa25.03■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 PMP22Q01453 160 aa25.03■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 ACSM2AQ08AH3 577 aa25.03■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 SPIN4Q56A73 249 aa25.03■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 ACSM2BQ68CK6 577 aa25.03■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa25.03■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 ZNF321PQ8N8H1 164 aa25.03■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 ZNF721Q8TF20 911 aa25.03■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 FBXL20Q96IG2 436 aa25.03■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 KCNA7Q96RP8 456 aa25.03■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 MKS1Q9NXB0 559 aa25.03■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 PLLPQ9Y342 182 aa25.03■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa25.02■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 GOLGA6L10A6NI86 522 aa25.02■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 WASHC1A8K0Z3 465 aa25.02■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 NME2P1O60361 137 aa25.02■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 NME2P22392 152 aa25.02■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 ERVK-8P63133 956 aa25.02■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 SPDYAQ5MJ70 313 aa25.02■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 GFRALQ6UXV0 394 aa25.02■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 SLC29A4Q7RTT9 530 aa25.02■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 MREGQ8N565 214 aa25.02■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 BANPQ8N9N5 519 aa25.02■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 CHTF18Q8WVB6 975 aa25.02■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 ACPTQ9BZG2 426 aa25.02■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa25.02■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 MCM8Q9UJA3 840 aa25.02■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 ERVK-19Q9WJR5 959 aa25.02■■□□□ 1.6
BRD4-208ENST00000597315 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa25.01■■□□□ 1.59
BRD4-208ENST00000597315 GALNSP34059 522 aa25.01■■□□□ 1.59
BRD4-208ENST00000597315 ALDH9A1P49189 494 aa25.01■■□□□ 1.59
BRD4-208ENST00000597315 HTR6P50406 440 aa25.01■■□□□ 1.59
BRD4-208ENST00000597315 XKP51811 444 aa25.01■■□□□ 1.59
BRD4-208ENST00000597315 HK2P52789 917 aa25.01■■□□□ 1.59
BRD4-208ENST00000597315 BTKQ06187 659 aa25.01■■□□□ 1.59
BRD4-208ENST00000597315 SPRED3Q2MJR0 410 aa25.01■■□□□ 1.59
BRD4-208ENST00000597315 KRT71Q3SY84 523 aa25.01■■□□□ 1.59
BRD4-208ENST00000597315 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
BRD4-208ENST00000597315 RNF111Q6ZNA4 994 aa25.01■■□□□ 1.59
BRD4-208ENST00000597315 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
BRD4-208ENST00000597315 C10orf107Q8IVU9 208 aa25.01■■□□□ 1.59
BRD4-208ENST00000597315 SEC14L3Q9UDX4 400 aa25.01■■□□□ 1.59
BRD4-208ENST00000597315 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa25.01■■□□□ 1.59
BRD4-208ENST00000597315 LRRK2Q5S007 2527 aa25■■□□□ 1.59
BRD4-208ENST00000597315 CLEC18AA5D8T8 446 aa25■■□□□ 1.59
BRD4-208ENST00000597315 TRIM13O60858 407 aa25■■□□□ 1.59
BRD4-208ENST00000597315 SPAG7O75391 227 aa25■■□□□ 1.59
BRD4-208ENST00000597315 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
BRD4-208ENST00000597315 CHN1P15882 459 aa25■■□□□ 1.59
BRD4-208ENST00000597315 HMGCS1Q01581 520 aa25■■□□□ 1.59
BRD4-208ENST00000597315 RBPJQ06330 500 aa25■■□□□ 1.59
BRD4-208ENST00000597315 FAM219BQ5XKK7 198 aa25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms