RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 FBXL20Q96IG2 436 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 ART5Q96L15 291 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 ALPK1Q96QP1 1244 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 SH3GL2Q99962 352 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 PHACTR1Q9C0D0 580 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC6A15Q9H2J7 730 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 SMYD2Q9NRG4 433 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 QPCTLQ9NXS2 382 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 CD274Q9NZQ7 290 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 DVL2O14641 736 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 SH3BGRLO75368 114 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM155BO75949 473 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 TGFB1P01137 390 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 BMP5P22003 454 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 DNASE1P24855 282 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 SERPINB1P30740 379 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 ASCL1P50553 236 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 ATP6V0D1P61421 351 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 BIKQ13323 160 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 MED27Q6P2C8 311 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 CHSY3Q70JA7 882 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 KLHL7Q8IXQ5 586 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 LAS2Q8IYD9 372 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 MMP21Q8N119 569 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 LIX1Q8N485 282 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 NAXEQ8NCW5 288 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM13CQ8NE31 585 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 OR10G3Q8NGC4 313 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM222BQ8WU58 562 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 TANKQ92844 425 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 UBE2E3Q969T4 207 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 MBD6Q96DN6 1003 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 TSPAN17Q96FV3 270 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 CMTM7Q96FZ5 175 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 KRT12Q99456 494 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 DOHHQ9BU89 302 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 CD244Q9BZW8 370 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 DMRT3Q9NQL9 472 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 DLL4Q9NR61 685 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 MS4A12Q9NXJ0 267 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 CNIH4Q9P003 139 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 CBLCQ9ULV8 474 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 RNF112Q9ULX5 631 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 EDARQ9UNE0 448 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 MPDZO75970 2070 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 DNHD1Q96M86 4753 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 AHRRA9YTQ3 701 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 SAP18O00422 153 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 LRATO95237 230 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 EPPINO95925 133 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 C1QAP02745 245 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 S100BP04271 92 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 PCNAP12004 261 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 TCP1P17987 556 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 TACR1P25103 407 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 GDF1P27539 372 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 SERPINB3P29508 390 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 TIMP3P35625 211 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 TRPC1P48995 793 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 DGKQP52824 942 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 HERVK_113P63132 956 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 ERVK-8P63133 956 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 ADAM8P78325 824 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 TNFRSF17Q02223 184 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 PCDH1Q08174 1060 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 CBLBQ13191 982 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 DUSP8Q13202 625 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 SLAMF1Q13291 335 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 EBPQ15125 230 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 NTRK2Q16620 822 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 SPRED3Q2MJR0 410 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 DEPDC1Q5TB30 811 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-226ENST00000593200 C18orf63Q68DL7 685 aa9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms