RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, human

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTIF-208	ENST00000590422	CPNE1	Q99829	537 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	CD244	Q9BZW8	370 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	OR51B5	Q9H339	312 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	NFU1	Q9UMS0	254 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	MED12	Q93074	2177 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	PLPP1	O14494	284 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	AQP7	O14520	342 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	SUPT3H	O75486	399 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	KRT38	O76015	456 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	LRAT	O95237	230 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422		P04436	131 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	TUBB	P07437	444 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	VSNL1	P62760	191 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	FOLH1	Q04609	750 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	LAPTM5	Q13571	262 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	SLMAP	Q14BN4	828 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	MPEG1	Q2M385	716 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	PIGG	Q5H8A4	983 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	MED27	Q6P2C8	311 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	OPN5	Q6U736	354 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	OR7G3	Q8NG95	312 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	NUBPL	Q8TB37	319 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	CDKL2	Q92772	493 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	ZNF559	Q9BR84	538 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	PROK2	Q9HC23	129 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	ABCA4	P78363	2273 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	ACAN	P16112	2415 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422		A0A1W2PS29	197 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	SUSD5	O60279	629 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	KERA	O60938	352 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	CLPS	P04118	112 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	MTHFD2	P13995	350 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	COX7A2	P14406	83 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	MAN2A2	P49641	1150 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	ART1	P52961	327 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	TNFRSF17	Q02223	184 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	PCDH1	Q08174	1060 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	MYBPH	Q13203	477 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	SLAMF1	Q13291	335 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	UCN3	Q969E3	161 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	FBXL20	Q96IG2	436 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	DGAT2	Q96PD7	388 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	FMO2	Q99518	471 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	RPF2	Q9H7B2	306 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	OPTC	Q9UBM4	332 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	RAB21	Q9UL25	225 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62

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