RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586312.5

PSME3-208, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 5

Gene PSME3, Length 752 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-208	ENST00000586312	NPHS1	O60500	1241 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PSME3-208	ENST00000586312	ZWINT	O95229	277 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PSME3-208	ENST00000586312	BSG	P35613	385 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PSME3-208	ENST00000586312	GSTM5	P46439	218 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PSME3-208	ENST00000586312	TDGF1P3	P51864	188 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PSME3-208	ENST00000586312	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
PSME3-208	ENST00000586312	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
PSME3-208	ENST00000586312	PCLAF	Q15004	111 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PSME3-208	ENST00000586312	ACER2	Q5QJU3	275 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PSME3-208	ENST00000586312	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PSME3-208	ENST00000586312	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PSME3-208	ENST00000586312	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PSME3-208	ENST00000586312	LGI4	Q8N135	537 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PSME3-208	ENST00000586312	METTL4	Q8N3J2	472 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PSME3-208	ENST00000586312	MORN4	Q8NDC4	146 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PSME3-208	ENST00000586312	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PSME3-208	ENST00000586312	PGM2	Q96G03	612 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PSME3-208	ENST00000586312	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PSME3-208	ENST00000586312	CSF3R	Q99062	836 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PSME3-208	ENST00000586312	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PSME3-208	ENST00000586312	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
PSME3-208	ENST00000586312	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
PSME3-208	ENST00000586312	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PSME3-208	ENST00000586312	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PSME3-208	ENST00000586312	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PSME3-208	ENST00000586312		A0A0A6YYD5	115 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	C1orf226	A1L170	272 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	OR5H15	A6NDH6	313 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	WIPF3	A6NGB9	483 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	C17orf105	B2RV13	164 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	SLC28A1	O00337	649 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	AZIN1	O14977	448 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	PROM1	O43490	865 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	LDB3	O75112	727 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	EED	O75530	441 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	ZFAND5	O76080	213 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	AGFG2	O95081	481 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	ALDH3A1	P30838	453 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	TUBA3C	Q13748	450 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	HEPACAM	Q14CZ8	416 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	HHAT	Q5VTY9	493 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	MDS2	Q8NDY4	140 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	C5orf34	Q96MH7	638 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	HES7	Q9BYE0	225 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	TIMM22	Q9Y584	194 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	ZNF780B	Q9Y6R6	833 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	PPP6C	O00743	305 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	PCDH7	O60245	1069 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	ETHE1	O95571	254 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	HSPA4L	O95757	839 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	GPR75	O95800	540 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	LDLR	P01130	860 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	GBA	P04062	536 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	GP1BB	P13224	206 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	EDN3	P14138	238 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	CD46	P15529	392 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	MST1	P26927	711 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	CD96	P40200	585 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	STT3A	P46977	705 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	ALDH9A1	P49189	494 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	GPR143	P51810	404 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	PMP22	Q01453	160 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	FOLH1	Q04609	750 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	BTK	Q06187	659 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	HSDL2	Q6YN16	418 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	TMEM156	Q8N614	296 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	HBEGF	Q99075	208 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	OR8D2	Q9GZM6	311 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	MCM8	Q9UJA3	840 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
PSME3-208	ENST00000586312	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		12.82	□□□□□ -0.36

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