RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMED1Q13445 227 aa15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TP53BP2Q13625 1128 aa15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC9A5Q14940 896 aa15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TCTN3Q6NUS6 607 aa15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KLHL17Q6TDP4 642 aa15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM92BQ6ZTR7 304 aa15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZBTB46Q86UZ6 589 aa15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TAGAPQ8N103 731 aa15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR2L3Q8NG85 312 aa15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC35G5Q96KT7 338 aa15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FBRSQ9HAH7 460 aa15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRDM7Q9NQW5 492 aa15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RHCGQ9UBD6 479 aa15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FTSJ1Q9UET6 329 aa15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ACAD8Q9UKU7 415 aa15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CORINQ9Y5Q5 1042 aa15.62■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMEM247A6NEH6 219 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PDZK1P1A8MUH7 402 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ANHXE9PGG2 379 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 M0R3G1 203 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MPZL2O60487 215 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ADAP00813 363 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 POU2F1P14859 743 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF12P17014 697 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NTSR1P30989 418 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CDC42P60953 191 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SHHQ15465 462 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RPE65Q16518 533 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMEM196Q5HYL7 178 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMEM64Q6YI46 380 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLCO6A1Q86UG4 719 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NDNFQ8TB73 568 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC38A4Q969I6 547 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR51I1Q9H343 314 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRDM8Q9NQV8 689 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ASB4Q9Y574 426 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C4orf51C9J302 202 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HAT1O14929 419 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KDM1AO60341 852 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SEMA7AO75326 666 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SERPINB7O75635 380 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CD36P16671 472 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CD72P21854 359 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CHMP24386 653 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NTSP30990 170 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GPC1P35052 558 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TSFMP43897 325 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CRISP1P54107 249 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 VBP1P61758 197 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OCA2Q04671 838 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DGUOKQ16854 277 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ATAT1Q5SQI0 421 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FRMPD2BQ6IN97 320 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ABHD17CQ6PCB6 329 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C16orf87Q6PH81 154 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TBC1D19Q8N5T2 526 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAIMQ9NVQ4 179 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TBCCD1Q9NVR7 557 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IMPAD1Q9NX62 359 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MOSPD1Q9UJG1 213 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DUSP12Q9UNI6 340 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SH3D21A4FU49 640 aa15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ERI3O43414 337 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC28A2O43868 658 aa15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PFDN1O60925 122 aa15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GUCY1B2O75343 617 aa15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR12D1P0DN82 309 aa15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OPRL1P41146 370 aa15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CTSKP43235 329 aa15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP15.6■□□□□ 0.091e-14■□□□□ 8.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLAMF1Q13291 335 aa15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF846Q147U1 533 aa15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM20CQ8IXL6 584 aa15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FBXL6Q8N531 539 aa15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR2L5Q8NG80 312 aa15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SFXN5Q8TD22 340 aa15.6■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ASB12Q8WXK4 309 aa15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.7 ms