RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580646.5

GGA3-209, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 829 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-209ENST00000580646 PRR35P0CG20 571 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 NR2F6P10588 404 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 COX6A1P12074 109 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 DRD2P14416 443 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 MAPK1P28482 360 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 AP2B1P63010 937 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 BTKQ06187 659 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 ZNF763Q0D2J5 394 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 HEPACAMQ14CZ8 416 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 NR6A1Q15406 480 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 NSDHLQ15738 373 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 SPDYAQ5MJ70 313 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 MFSD4BQ5TF39 518 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 FAM219BQ5XKK7 198 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 OR52E8Q6IFG1 317 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 SCIMPQ6UWF3 145 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 IGFL3Q6UXB1 125 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 NDUFAF7Q7L592 441 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 ANKRD37Q7Z713 158 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 CRLF3Q8IUI8 442 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 DDIASQ8IXT1 998 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 Q8NA96 180 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 TMEM52Q8NDY8 209 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 OR11G2Q8NGC1 345 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 OR2T11Q8NH01 316 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 AGR3Q8TD06 166 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 STON2Q8WXE9 905 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 PNPLA2Q96AD5 504 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 TM4SF18Q96CE8 201 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 PTCHD1Q96NR3 888 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 TUBB6Q9BUF5 446 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 FAIM2Q9BWQ8 316 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 ZNF700Q9H0M5 742 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 MEAF6Q9HAF1 191 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 MYNNQ9NPC7 610 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 ASIC5Q9NY37 505 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 EHD3Q9NZN3 535 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 LUZP4Q9P127 313 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 FBXW2Q9UKT8 454 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa9.26□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 TEX15Q9BXT5 2789 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 FAM227AF5H4B4 570 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 TGDSO95455 350 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 AIFM1O95831 613 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 GBAP04062 536 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 ICAM2P13598 275 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 GALNSP34059 522 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 ASMTP46597 345 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 BTG2P78543 158 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 SLC13A2Q13183 592 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 PCOLCEQ15113 449 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 C6orf136Q5SQH8 315 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 C18orf63Q68DL7 685 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 NOXRED1Q6NXP6 359 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 SLC48A1Q6P1K1 146 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 SHISA5Q8N114 240 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 ZADH2Q8N4Q0 377 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 FAM47BQ8NA70 645 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 GALNT11Q8NCW6 608 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 DNAJB14Q8TBM8 379 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 C16orf78Q8WTQ4 265 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 TM9SF4Q92544 642 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 C8orf44Q96CB5 159 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 C3orf30Q96M34 536 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 MESP1Q9BRJ9 268 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 RBCK1Q9BYM8 510 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 LHPPQ9H008 270 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 CCDC134Q9H6E4 229 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 ADAP2Q9NPF8 381 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 NECTIN3Q9NQS3 549 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 PNPOQ9NVS9 261 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 TAS2R7Q9NYW3 318 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 CES1P1Q9UKY3 287 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 PSME2Q9UL46 239 aa9.25□□□□□ -0.93
GGA3-209ENST00000580646 VPS4AQ9UN37 437 aa9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms