RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580237.5

NDEL1-208, Transcript of nudE neurodevelopment protein 1 like 1, human

TSL 4

Gene NDEL1, Length 577 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NDEL1-208	ENST00000580237	CAVIN3	Q969G5	261 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	TAAR6	Q96RI8	345 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	KCNA7	Q96RP8	456 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	SMC6	Q96SB8	1091 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	HPF1	Q9NWY4	346 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	YARS2	Q9Y2Z4	477 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	ASB4	Q9Y574	426 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	POLE	Q07864	2286 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	GTF3C1	Q12789	2109 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237		G3V2L1	256 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237		H3BQF6	201 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	CDK2AP1	O14519	115 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	PCDH7	O60245	1069 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	NME2P1	O60361	137 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	OR2J2	O76002	312 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	NEURL1	O76050	574 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	UNC5C	O95185	931 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	GPR75	O95800	540 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	DDAH2	O95865	285 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	SP1	P08047	785 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	ZNF24	P17028	368 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	NT5E	P21589	574 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	NME2	P22392	152 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	HTR6	P50406	440 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	HK2	P52789	917 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	NAGLU	P54802	743 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	RNF4	P78317	190 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	RBPJ	Q06330	500 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	KRT71	Q3SY84	523 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	SPIN4	Q56A73	249 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	LIPM	Q5VYY2	423 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	SLC25A25	Q6KCM7	469 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	ZNF321P	Q8N8H1	164 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	DOK4	Q8TEW6	326 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	RIT1	Q92963	219 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	KLHL29	Q96CT2	875 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	SCMH1	Q96GD3	660 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	FBXL20	Q96IG2	436 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	ACPT	Q9BZG2	426 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	MYOT	Q9UBF9	498 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	ZNF225	Q9UK10	706 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	TIMM22	Q9Y584	194 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	C1orf226	A1L170	272 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	PRKN	O60260	465 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	SPAG7	O75391	227 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	SOX3	P41225	446 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	PER3	P56645	1201 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	KCNK10	P57789	538 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	DNAJB13	P59910	316 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	HMGCS1	Q01581	520 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	SLC18A2	Q05940	514 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	BTK	Q06187	659 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	TRABD2A	Q86V40	505 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		10.12	□□□□□ -0.79

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