RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580081.1

CLTC-212, Transcript of clathrin heavy chain, humanhuman

TSL 4

Gene CLTC, Length 575 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTC-212ENST00000580081 AMDHD1Q96NU7 426 aa8.26□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 STRADBQ9C0K7 418 aa8.26□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa8.26□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 MUC13Q9H3R2 512 aa8.26□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 RAD21L1Q9H4I0 556 aa8.26□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 SLAMF7Q9NQ25 335 aa8.26□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 SEMA3GQ9NS98 782 aa8.26□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 SLC6A13Q9NSD5 602 aa8.26□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 HCN3Q9P1Z3 774 aa8.26□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 C5AR2Q9P296 337 aa8.26□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 CD300AQ9UGN4 299 aa8.26□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 NDOR1Q9UHB4 597 aa8.26□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 BCAP29Q9UHQ4 241 aa8.26□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 LAMA1P25391 3075 aa8.26□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 EFCAB7A8K855 629 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 B4E171 279 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 CLIC1O00299 241 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 CLDN4O14493 209 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 DNAJB6O75190 326 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 SLITRK5O94991 958 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 STAMBPO95630 424 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 KRT75O95678 551 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 GPR75O95800 540 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 IFI6P09912 130 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 FBLP22087 321 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 ALAS2P22557 587 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 UQCRC2P22695 453 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 HTR1EP28566 365 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 GPC1P35052 558 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 SOAT1P35610 550 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 TSPAN7P41732 249 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 MAGEA8P43361 318 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 GSK3BP49841 420 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 PDX1P52945 283 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 MC2RQ01718 297 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 FOLH1Q04609 750 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 LIPEQ05469 1076 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 VAC14Q08AM6 782 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 HSPB3Q12988 150 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 C1orf146Q5VVC0 180 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 CDCP2Q5VXM1 449 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 TMEM64Q6YI46 380 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 TMEM126BQ8IUX1 230 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 BMPERQ8N8U9 685 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 C7orf57Q8NEG2 295 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 TNIP2Q8NFZ5 429 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 OR51Q1Q8NH59 317 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 SFXN5Q8TD22 340 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 ZFP90Q8TF47 636 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 UCN3Q969E3 161 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 MOAP1Q96BY2 351 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 TBC1D20Q96BZ9 403 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 ASB9Q96DX5 294 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 ZNF681Q96N22 645 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 OR1F2PQ96R84 312 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 CMKLR1Q99788 373 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 ECSITQ9BQ95 431 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 SLC35A5Q9BS91 424 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 SPATA9Q9BWV2 254 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 GLIPR2Q9H4G4 154 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 ALG2Q9H553 416 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 CXorf36Q9H7Y0 433 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 TPT1P8Q9HAU6 139 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 ZNF304Q9HCX3 659 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 FBXO8Q9NRD0 319 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 ERVK-11Q9UQG0 969 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 POMPQ9Y244 141 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 MUC6Q6W4X9 2439 aa8.25□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 CROCCQ5TZA2 2017 aa8.24□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 SCN3AQ9NY46 2000 aa8.24□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa8.24□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 WASHC1A8K0Z3 465 aa8.24□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 FAM220BPB1ANY3 271 aa8.24□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 WIPF1O43516 503 aa8.24□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 FGF17O60258 216 aa8.24□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 CTNSO60931 367 aa8.24□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 SCRG1O75711 98 aa8.24□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 BMP10O95393 424 aa8.24□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 ATP1B1P05026 303 aa8.24□□□□□ -1.09
CLTC-212ENST00000580081 FHP07954 510 aa8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.5 ms