RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574728.1

PRPF8-211, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 466 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-211ENST00000574728 CTAGE9A4FU28 777 aa4.55□□□□□ -1.68
PRPF8-211ENST00000574728 OR6C74A6NCV1 312 aa4.55□□□□□ -1.68
PRPF8-211ENST00000574728 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PRPF8-211ENST00000574728 H0Y3Z8 333 aa4.55□□□□□ -1.68
PRPF8-211ENST00000574728 AP3B1O00203 1094 aa4.55□□□□□ -1.68
PRPF8-211ENST00000574728 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PRPF8-211ENST00000574728 RAD51CO43502 376 aa4.55□□□□□ -1.68
PRPF8-211ENST00000574728 NIPSNAP2O75323 286 aa4.55□□□□□ -1.68
PRPF8-211ENST00000574728 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
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PRPF8-211ENST00000574728 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa4.54□□□□□ -1.68
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PRPF8-211ENST00000574728 FAM155BO75949 473 aa4.54□□□□□ -1.68
PRPF8-211ENST00000574728 C1orf105O95561 183 aa4.54□□□□□ -1.68
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PRPF8-211ENST00000574728 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PRPF8-211ENST00000574728 OR56A5P0C7T3 313 aa4.54□□□□□ -1.68
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