RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554118.1

LRP1-206, Transcript of LDL receptor related protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene LRP1, Length 418 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1-206ENST00000554118 CLDN8P56748 225 aa7.3□□□□□ -1.24
LRP1-206ENST00000554118 OCA2Q04671 838 aa7.3□□□□□ -1.24
LRP1-206ENST00000554118 MAP7Q14244 749 aa7.3□□□□□ -1.24
LRP1-206ENST00000554118 SQLEQ14534 574 aa7.3□□□□□ -1.24
LRP1-206ENST00000554118 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LRP1-206ENST00000554118 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa7.3□□□□□ -1.24
LRP1-206ENST00000554118 MFSD4BQ5TF39 518 aa7.3□□□□□ -1.24
LRP1-206ENST00000554118 MLIPQ5VWP3 458 aa7.3□□□□□ -1.24
LRP1-206ENST00000554118 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
LRP1-206ENST00000554118 OR52E8Q6IFG1 317 aa7.3□□□□□ -1.24
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LRP1-206ENST00000554118 COX15Q7KZN9 410 aa7.3□□□□□ -1.24
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LRP1-206ENST00000554118 MCEMP1Q8IX19 187 aa7.3□□□□□ -1.24
LRP1-206ENST00000554118 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa7.3□□□□□ -1.24
LRP1-206ENST00000554118 NLGN4XQ8N0W4 816 aa7.3□□□□□ -1.24
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LRP1-206ENST00000554118 ESX1Q8N693 406 aa7.3□□□□□ -1.24
LRP1-206ENST00000554118 ANKS4BQ8N8V4 417 aa7.3□□□□□ -1.24
LRP1-206ENST00000554118 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
LRP1-206ENST00000554118 STARD8Q92502 1023 aa7.3□□□□□ -1.24
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LRP1-206ENST00000554118 MIEF2Q96C03 454 aa7.3□□□□□ -1.24
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LRP1-206ENST00000554118 EGLN2Q96KS0 407 aa7.3□□□□□ -1.24
LRP1-206ENST00000554118 OR1F2PQ96R84 312 aa7.3□□□□□ -1.24
LRP1-206ENST00000554118 CSF3RQ99062 836 aa7.3□□□□□ -1.24
LRP1-206ENST00000554118 ZBTB18Q99592 522 aa7.3□□□□□ -1.24
LRP1-206ENST00000554118 RBCK1Q9BYM8 510 aa7.3□□□□□ -1.24
LRP1-206ENST00000554118 DPY30Q9C005 99 aa7.3□□□□□ -1.24
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LRP1-206ENST00000554118 CHST8Q9H2A9 424 aa7.3□□□□□ -1.24
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LRP1-206ENST00000554118 C14orf105Q9NVL8 296 aa7.3□□□□□ -1.24
LRP1-206ENST00000554118 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
LRP1-206ENST00000554118 KCMF1Q9P0J7 381 aa7.3□□□□□ -1.24
LRP1-206ENST00000554118 CTSFQ9UBX1 484 aa7.3□□□□□ -1.24
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LRP1-206ENST00000554118 ATG4BQ9Y4P1 393 aa7.3□□□□□ -1.24
LRP1-206ENST00000554118 GPR45Q9Y5Y3 372 aa7.3□□□□□ -1.24
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LRP1-206ENST00000554118 C1orf226A1L170 272 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP1-206ENST00000554118 GLOD5A6NK44 160 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP1-206ENST00000554118 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LRP1-206ENST00000554118 FAM227AF5H4B4 570 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP1-206ENST00000554118 CLDN4O14493 209 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP1-206ENST00000554118 FCHO1O14526 889 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP1-206ENST00000554118 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LRP1-206ENST00000554118 B4GALT2O60909 372 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP1-206ENST00000554118 SLC22A3O75751 556 aa7.29□□□□□ -1.24
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LRP1-206ENST00000554118 BMP10O95393 424 aa7.29□□□□□ -1.24
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LRP1-206ENST00000554118 MC1RQ01726 317 aa7.29□□□□□ -1.24
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LRP1-206ENST00000554118 NCF4Q15080 339 aa7.29□□□□□ -1.24
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LRP1-206ENST00000554118 C18orf63Q68DL7 685 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP1-206ENST00000554118 FAM71E1Q6IPT2 247 aa7.29□□□□□ -1.24
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LRP1-206ENST00000554118 ZNF385DQ9H6B1 395 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP1-206ENST00000554118 REEP4Q9H6H4 257 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP1-206ENST00000554118 WDR54Q9H977 334 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP1-206ENST00000554118 PRDM9Q9NQV7 894 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP1-206ENST00000554118 SAR1AQ9NR31 198 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP1-206ENST00000554118 SLC22A11Q9NSA0 550 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP1-206ENST00000554118 ATAD3AQ9NVI7 634 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP1-206ENST00000554118 EHD3Q9NZN3 535 aa7.29□□□□□ -1.24
LRP1-206ENST00000554118 ZIM2Q9NZV7 527 aa7.29□□□□□ -1.24
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