RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 SNTG1Q9NSN8 517 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 MYH1P12882 1939 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 NHSQ6T4R5 1651 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 INMTO95050 263 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 H2BFMP0C1H6 154 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 YAP1P46937 504 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 GXYLT1Q4G148 440 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 LRRC73Q5JTD7 316 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 CRTC1Q6UUV9 634 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 STX12Q86Y82 276 aa8.13□□□□□ -1.11
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PTPRB-208ENST00000550358 GPR174Q9BXC1 333 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 DCSTAMPQ9H295 470 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 ADAM7Q9H2U9 754 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 TTC34A8MYJ7 566 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 M0R129 80 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 TRAPPC6AO75865 159 aa8.13□□□□□ -1.11
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PTPRB-208ENST00000550358 HCKP08631 526 aa8.13□□□□□ -1.11
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PTPRB-208ENST00000550358 CLLU1OSQ5K130 101 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 CNTN4Q8IWV2 1026 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 SIX5Q8N196 739 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 THAP6Q8TBB0 222 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 SLC7A13Q8TCU3 470 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 BRD7Q9NPI1 651 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 INPP5EQ9NRR6 644 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 TAS2R8Q9NYW2 309 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 RNF6Q9Y252 685 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 NRAPQ86VF7 1730 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 A8MUA0 341 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 CCRL2O00421 344 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 RAD51DO75771 328 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 SLC35E2BP0CK96 405 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 BCKDHAP12694 445 aa8.13□□□□□ -1.11
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PTPRB-208ENST00000550358 BPIP17213 487 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 GGT1P19440 569 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 GABRA3P34903 492 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 C1orf220Q5T0J3 134 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 NANOGP8Q6NSW7 305 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 RANBP10Q6VN20 620 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF101Q8IZC7 436 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 OR2T4Q8NH00 348 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 AIFM2Q9BRQ8 373 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 APOOQ9BUR5 198 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 NANOGQ9H9S0 305 aa8.13□□□□□ -1.11
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PTPRB-208ENST00000550358 A6NCN8 305 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 THEGLP0DJG4 465 aa8.13□□□□□ -1.11
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PTPRB-208ENST00000550358 ZNF181Q2M3W8 571 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 GGTA1PQ4G0N0 100 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 HACD4Q5VWC8 232 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 MISPQ8IVT2 679 aa8.13□□□□□ -1.11
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PTPRB-208ENST00000550358 OR2L2Q8NH16 312 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 OR5AK3PQ8NH89 298 aa8.13□□□□□ -1.11
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PTPRB-208ENST00000550358 IL4I1Q96RQ9 567 aa8.13□□□□□ -1.11
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PTPRB-208ENST00000550358 LSM1O15116 133 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 SNNO75324 88 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 MTX2O75431 263 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 IL33O95760 270 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 POU2F1P14859 743 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 CRABP1P29762 137 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 DSC1Q08554 894 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 DOC2AQ14183 400 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 ESAMQ96AP7 390 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 LPAR4Q99677 370 aa8.13□□□□□ -1.11
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