RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 SPSB2Q99619 263 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-216ENST00000549221 SLC39A3Q9BRY0 314 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-216ENST00000549221 SLC25A23Q9BV35 468 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-216ENST00000549221 YIPF2Q9BWQ6 316 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-216ENST00000549221 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
CS-216ENST00000549221 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-216ENST00000549221 TRIM8Q9BZR9 551 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-216ENST00000549221 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
CS-216ENST00000549221 VN1R1Q9GZP7 353 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-216ENST00000549221 GLIPR2Q9H4G4 154 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-216ENST00000549221 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
CS-216ENST00000549221 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
CS-216ENST00000549221 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-216ENST00000549221 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-216ENST00000549221 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
CS-216ENST00000549221 MS4A12Q9NXJ0 267 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-216ENST00000549221 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-216ENST00000549221 TAGLN3Q9UI15 199 aa7.65□□□□□ -1.18
CS-216ENST00000549221 LOC400499M0QZD8 3231 aa7.65□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 ITPR1Q14643 2758 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 ERICH4A6NGS2 130 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 MYO1GB0I1T2 1018 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 TERTO14746 1132 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
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CS-216ENST00000549221 NVLO15381 856 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 PDPK1O15530 556 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 GPR75O95800 540 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 GSNP06396 782 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 CT62P0C5K7 136 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 ZGLP1P0C6A0 271 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 PCSK2P16519 638 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 CPOXP36551 454 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 RPL3P39023 403 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 NUDT2P50583 147 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 XKP51811 444 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 NCALDP61601 193 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 HBA1P69905 142 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 FOXC1Q12948 553 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 MAPRE2Q15555 327 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 ZSCAN26Q16670 478 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 DPY19L1Q2PZI1 675 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 MINDY4Q4G0A6 757 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 MLIPQ5VWP3 458 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 CPZQ66K79 652 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 DLEU7Q6UYE1 221 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 LANCL3Q6ZV70 420 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 OVCH1Q7RTY7 1134 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 ZNF595Q8IYB9 648 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 CCDC116Q8IYX3 515 aa7.64□□□□□ -1.19
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CS-216ENST00000549221 OR9A2Q8NGT5 310 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 TSPEARQ8WU66 669 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 CT55Q8WUE5 264 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 STARD8Q92502 1023 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 TANKQ92844 425 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 FKBP10Q96AY3 582 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 CMTM5Q96DZ9 223 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 CCDC115Q96NT0 180 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 AMDHD1Q96NU7 426 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 OR1F2PQ96R84 312 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 ZPBPQ9BS86 351 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 TGIF2Q9GZN2 237 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 SLC26A1Q9H2B4 701 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 IKZF5Q9H5V7 419 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 CXorf36Q9H7Y0 433 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 ANKRA2Q9H9E1 313 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 WDR41Q9HAD4 459 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 IL1RL2Q9HB29 575 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 PRDM9Q9NQV7 894 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 MRGBPQ9NV56 204 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
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CS-216ENST00000549221 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 BTNL2Q9UIR0 455 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 ACSL6Q9UKU0 697 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa7.64□□□□□ -1.19
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CS-216ENST00000549221 SPACA6W5XKT8 324 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 CROCCQ5TZA2 2017 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 CCDC88CQ9P219 2028 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-216ENST00000549221 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
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