RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548557.1

CASC18-202, Transcript of cancer susceptibility 18, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CASC18, Length 2,503 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC18-202ENST00000548557 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa6.26□□□□□ -1.41
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CASC18-202ENST00000548557 HIST1H2AJQ99878 128 aa6.26□□□□□ -1.41
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CASC18-202ENST00000548557 SNTNA6NMZ2 147 aa6.25□□□□□ -1.41
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CASC18-202ENST00000548557 IDH3BO43837 385 aa6.25□□□□□ -1.41
CASC18-202ENST00000548557 PTP4A3O75365 173 aa6.25□□□□□ -1.41
CASC18-202ENST00000548557 CLIC3O95833 236 aa6.25□□□□□ -1.41
CASC18-202ENST00000548557 LDLRP01130 860 aa6.25□□□□□ -1.41
CASC18-202ENST00000548557 ANXA6P08133 673 aa6.25□□□□□ -1.41
CASC18-202ENST00000548557 SYPP08247 313 aa6.25□□□□□ -1.41
CASC18-202ENST00000548557 G6PDP11413 515 aa6.25□□□□□ -1.41
CASC18-202ENST00000548557 F3P13726 295 aa6.25□□□□□ -1.41
CASC18-202ENST00000548557 SCAND1P57086 179 aa6.25□□□□□ -1.41
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CASC18-202ENST00000548557 ABRQ12979 859 aa6.25□□□□□ -1.41
CASC18-202ENST00000548557 KIR2DS5Q14953 304 aa6.25□□□□□ -1.41
CASC18-202ENST00000548557 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP6.25□□□□□ -1.41
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CASC18-202ENST00000548557 ZNF542PQ5EBM4 170 aa6.25□□□□□ -1.41
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CASC18-202ENST00000548557 GLYATQ6IB77 296 aa6.25□□□□□ -1.41
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CASC18-202ENST00000548557 CYP20A1Q6UW02 462 aa6.25□□□□□ -1.41
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CASC18-202ENST00000548557 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CASC18-202ENST00000548557 CPOQ8IVL8 374 aa6.25□□□□□ -1.41
CASC18-202ENST00000548557 ATG16L2Q8NAA4 619 aa6.25□□□□□ -1.41
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CASC18-202ENST00000548557 CLHC1Q8NHS4 586 aa6.25□□□□□ -1.41
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